Protein–RNA interactions for Protein: Q2TAL6

VWC2, Brorin, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWC2Q2TAL6 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VWC2Q2TAL6 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VWC2Q2TAL6 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VWC2Q2TAL6 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VWC2Q2TAL6 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VWC2Q2TAL6 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VWC2Q2TAL6 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VWC2Q2TAL6 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VWC2Q2TAL6 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VWC2Q2TAL6 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VWC2Q2TAL6 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VWC2Q2TAL6 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VWC2Q2TAL6 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VWC2Q2TAL6 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
VWC2Q2TAL6 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VWC2Q2TAL6 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
VWC2Q2TAL6 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VWC2Q2TAL6 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
VWC2Q2TAL6 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
VWC2Q2TAL6 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VWC2Q2TAL6 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VWC2Q2TAL6 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VWC2Q2TAL6 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VWC2Q2TAL6 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VWC2Q2TAL6 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
VWC2Q2TAL6 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VWC2Q2TAL6 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VWC2Q2TAL6 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
VWC2Q2TAL6 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VWC2Q2TAL6 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VWC2Q2TAL6 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
VWC2Q2TAL6 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VWC2Q2TAL6 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
VWC2Q2TAL6 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
VWC2Q2TAL6 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
VWC2Q2TAL6 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
VWC2Q2TAL6 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VWC2Q2TAL6 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
VWC2Q2TAL6 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VWC2Q2TAL6 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VWC2Q2TAL6 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VWC2Q2TAL6 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VWC2Q2TAL6 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VWC2Q2TAL6 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VWC2Q2TAL6 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VWC2Q2TAL6 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VWC2Q2TAL6 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VWC2Q2TAL6 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VWC2Q2TAL6 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VWC2Q2TAL6 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VWC2Q2TAL6 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VWC2Q2TAL6 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VWC2Q2TAL6 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VWC2Q2TAL6 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VWC2Q2TAL6 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VWC2Q2TAL6 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
VWC2Q2TAL6 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
VWC2Q2TAL6 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
VWC2Q2TAL6 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VWC2Q2TAL6 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VWC2Q2TAL6 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
VWC2Q2TAL6 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
VWC2Q2TAL6 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VWC2Q2TAL6 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VWC2Q2TAL6 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VWC2Q2TAL6 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
VWC2Q2TAL6 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VWC2Q2TAL6 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VWC2Q2TAL6 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VWC2Q2TAL6 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VWC2Q2TAL6 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VWC2Q2TAL6 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VWC2Q2TAL6 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VWC2Q2TAL6 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
VWC2Q2TAL6 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VWC2Q2TAL6 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VWC2Q2TAL6 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VWC2Q2TAL6 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
VWC2Q2TAL6 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VWC2Q2TAL6 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VWC2Q2TAL6 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
VWC2Q2TAL6 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
VWC2Q2TAL6 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VWC2Q2TAL6 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
VWC2Q2TAL6 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
VWC2Q2TAL6 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
VWC2Q2TAL6 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VWC2Q2TAL6 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
VWC2Q2TAL6 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
VWC2Q2TAL6 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
VWC2Q2TAL6 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VWC2Q2TAL6 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
VWC2Q2TAL6 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VWC2Q2TAL6 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
VWC2Q2TAL6 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
VWC2Q2TAL6 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VWC2Q2TAL6 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VWC2Q2TAL6 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
VWC2Q2TAL6 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
VWC2Q2TAL6 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms