Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC142Q17RM4 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC142Q17RM4 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CCDC142Q17RM4 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CCDC142Q17RM4 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CCDC142Q17RM4 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC142Q17RM4 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC142Q17RM4 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC142Q17RM4 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC142Q17RM4 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC142Q17RM4 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC142Q17RM4 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC142Q17RM4 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC142Q17RM4 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC142Q17RM4 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC142Q17RM4 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC142Q17RM4 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC142Q17RM4 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC142Q17RM4 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC142Q17RM4 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC142Q17RM4 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC142Q17RM4 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC142Q17RM4 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC142Q17RM4 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC142Q17RM4 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC142Q17RM4 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC142Q17RM4 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC142Q17RM4 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC142Q17RM4 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC142Q17RM4 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC142Q17RM4 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC142Q17RM4 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC142Q17RM4 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC142Q17RM4 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC142Q17RM4 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC142Q17RM4 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC142Q17RM4 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC142Q17RM4 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC142Q17RM4 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC142Q17RM4 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC142Q17RM4 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC142Q17RM4 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC142Q17RM4 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC142Q17RM4 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC142Q17RM4 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC142Q17RM4 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC142Q17RM4 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC142Q17RM4 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC142Q17RM4 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC142Q17RM4 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC142Q17RM4 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC142Q17RM4 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC142Q17RM4 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC142Q17RM4 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC142Q17RM4 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC142Q17RM4 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC142Q17RM4 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC142Q17RM4 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC142Q17RM4 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC142Q17RM4 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC142Q17RM4 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC142Q17RM4 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC142Q17RM4 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC142Q17RM4 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC142Q17RM4 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC142Q17RM4 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC142Q17RM4 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC142Q17RM4 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC142Q17RM4 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC142Q17RM4 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC142Q17RM4 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC142Q17RM4 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC142Q17RM4 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC142Q17RM4 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC142Q17RM4 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC142Q17RM4 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC142Q17RM4 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC142Q17RM4 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC142Q17RM4 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC142Q17RM4 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC142Q17RM4 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC142Q17RM4 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC142Q17RM4 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC142Q17RM4 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC142Q17RM4 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC142Q17RM4 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC142Q17RM4 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC142Q17RM4 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC142Q17RM4 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC142Q17RM4 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC142Q17RM4 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC142Q17RM4 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC142Q17RM4 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC142Q17RM4 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC142Q17RM4 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC142Q17RM4 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC142Q17RM4 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC142Q17RM4 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC142Q17RM4 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC142Q17RM4 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
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