Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IMPG1Q17R60 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IMPG1Q17R60 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IMPG1Q17R60 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IMPG1Q17R60 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IMPG1Q17R60 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
IMPG1Q17R60 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IMPG1Q17R60 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IMPG1Q17R60 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IMPG1Q17R60 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IMPG1Q17R60 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
IMPG1Q17R60 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
IMPG1Q17R60 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
IMPG1Q17R60 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
IMPG1Q17R60 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IMPG1Q17R60 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IMPG1Q17R60 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IMPG1Q17R60 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IMPG1Q17R60 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IMPG1Q17R60 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IMPG1Q17R60 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IMPG1Q17R60 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IMPG1Q17R60 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IMPG1Q17R60 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IMPG1Q17R60 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IMPG1Q17R60 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
IMPG1Q17R60 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IMPG1Q17R60 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IMPG1Q17R60 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IMPG1Q17R60 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IMPG1Q17R60 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IMPG1Q17R60 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IMPG1Q17R60 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IMPG1Q17R60 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IMPG1Q17R60 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
IMPG1Q17R60 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IMPG1Q17R60 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IMPG1Q17R60 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IMPG1Q17R60 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IMPG1Q17R60 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IMPG1Q17R60 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IMPG1Q17R60 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IMPG1Q17R60 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IMPG1Q17R60 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IMPG1Q17R60 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IMPG1Q17R60 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IMPG1Q17R60 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IMPG1Q17R60 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IMPG1Q17R60 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IMPG1Q17R60 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IMPG1Q17R60 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IMPG1Q17R60 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IMPG1Q17R60 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IMPG1Q17R60 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IMPG1Q17R60 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IMPG1Q17R60 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IMPG1Q17R60 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IMPG1Q17R60 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IMPG1Q17R60 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IMPG1Q17R60 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IMPG1Q17R60 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
IMPG1Q17R60 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IMPG1Q17R60 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
IMPG1Q17R60 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IMPG1Q17R60 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IMPG1Q17R60 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IMPG1Q17R60 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
IMPG1Q17R60 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IMPG1Q17R60 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IMPG1Q17R60 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IMPG1Q17R60 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IMPG1Q17R60 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IMPG1Q17R60 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IMPG1Q17R60 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IMPG1Q17R60 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IMPG1Q17R60 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IMPG1Q17R60 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IMPG1Q17R60 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IMPG1Q17R60 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
IMPG1Q17R60 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IMPG1Q17R60 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IMPG1Q17R60 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IMPG1Q17R60 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IMPG1Q17R60 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IMPG1Q17R60 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IMPG1Q17R60 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IMPG1Q17R60 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IMPG1Q17R60 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IMPG1Q17R60 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IMPG1Q17R60 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IMPG1Q17R60 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IMPG1Q17R60 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IMPG1Q17R60 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IMPG1Q17R60 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IMPG1Q17R60 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IMPG1Q17R60 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IMPG1Q17R60 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IMPG1Q17R60 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IMPG1Q17R60 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IMPG1Q17R60 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
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