Protein–RNA interactions for Protein: Q16831

UPP1, Uridine phosphorylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1Q16831 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
UPP1Q16831 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
UPP1Q16831 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
UPP1Q16831 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
UPP1Q16831 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
UPP1Q16831 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
UPP1Q16831 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
UPP1Q16831 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
UPP1Q16831 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
UPP1Q16831 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
UPP1Q16831 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
UPP1Q16831 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
UPP1Q16831 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
UPP1Q16831 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
UPP1Q16831 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
UPP1Q16831 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
UPP1Q16831 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
UPP1Q16831 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
UPP1Q16831 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
UPP1Q16831 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
UPP1Q16831 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
UPP1Q16831 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
UPP1Q16831 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
UPP1Q16831 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
UPP1Q16831 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
UPP1Q16831 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
UPP1Q16831 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
UPP1Q16831 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
UPP1Q16831 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
UPP1Q16831 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
UPP1Q16831 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
UPP1Q16831 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
UPP1Q16831 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
UPP1Q16831 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
UPP1Q16831 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
UPP1Q16831 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
UPP1Q16831 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
UPP1Q16831 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
UPP1Q16831 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
UPP1Q16831 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
UPP1Q16831 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
UPP1Q16831 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
UPP1Q16831 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
UPP1Q16831 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
UPP1Q16831 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
UPP1Q16831 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
UPP1Q16831 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
UPP1Q16831 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
UPP1Q16831 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
UPP1Q16831 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
UPP1Q16831 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
UPP1Q16831 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
UPP1Q16831 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
UPP1Q16831 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
UPP1Q16831 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
UPP1Q16831 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
UPP1Q16831 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
UPP1Q16831 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
UPP1Q16831 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
UPP1Q16831 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
UPP1Q16831 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
UPP1Q16831 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
UPP1Q16831 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
UPP1Q16831 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
UPP1Q16831 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
UPP1Q16831 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
UPP1Q16831 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
UPP1Q16831 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
UPP1Q16831 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
UPP1Q16831 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
UPP1Q16831 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
UPP1Q16831 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
UPP1Q16831 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
UPP1Q16831 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
UPP1Q16831 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
UPP1Q16831 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
UPP1Q16831 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
UPP1Q16831 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
UPP1Q16831 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
UPP1Q16831 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
UPP1Q16831 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
UPP1Q16831 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
UPP1Q16831 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
UPP1Q16831 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
UPP1Q16831 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
UPP1Q16831 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
UPP1Q16831 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
UPP1Q16831 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
UPP1Q16831 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
UPP1Q16831 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
UPP1Q16831 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
UPP1Q16831 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
UPP1Q16831 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
UPP1Q16831 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
UPP1Q16831 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
UPP1Q16831 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
UPP1Q16831 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
UPP1Q16831 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
UPP1Q16831 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
UPP1Q16831 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms