Protein–RNA interactions for Protein: Q16821

PPP1R3A, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 3A, humanhuman

Predictions only

Length 1,122 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R3AQ16821 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PPP1R3AQ16821 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PPP1R3AQ16821 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PPP1R3AQ16821 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PPP1R3AQ16821 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PPP1R3AQ16821 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PPP1R3AQ16821 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PPP1R3AQ16821 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PPP1R3AQ16821 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PPP1R3AQ16821 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PPP1R3AQ16821 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PPP1R3AQ16821 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PPP1R3AQ16821 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PPP1R3AQ16821 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PPP1R3AQ16821 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PPP1R3AQ16821 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PPP1R3AQ16821 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PPP1R3AQ16821 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PPP1R3AQ16821 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PPP1R3AQ16821 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PPP1R3AQ16821 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PPP1R3AQ16821 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PPP1R3AQ16821 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PPP1R3AQ16821 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PPP1R3AQ16821 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PPP1R3AQ16821 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPP1R3AQ16821 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPP1R3AQ16821 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPP1R3AQ16821 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PPP1R3AQ16821 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPP1R3AQ16821 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPP1R3AQ16821 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPP1R3AQ16821 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PPP1R3AQ16821 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PPP1R3AQ16821 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PPP1R3AQ16821 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PPP1R3AQ16821 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PPP1R3AQ16821 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PPP1R3AQ16821 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PPP1R3AQ16821 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PPP1R3AQ16821 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PPP1R3AQ16821 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PPP1R3AQ16821 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PPP1R3AQ16821 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPP1R3AQ16821 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPP1R3AQ16821 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPP1R3AQ16821 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPP1R3AQ16821 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPP1R3AQ16821 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPP1R3AQ16821 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPP1R3AQ16821 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPP1R3AQ16821 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PPP1R3AQ16821 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PPP1R3AQ16821 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PPP1R3AQ16821 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PPP1R3AQ16821 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PPP1R3AQ16821 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPP1R3AQ16821 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPP1R3AQ16821 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPP1R3AQ16821 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPP1R3AQ16821 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPP1R3AQ16821 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPP1R3AQ16821 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPP1R3AQ16821 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PPP1R3AQ16821 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PPP1R3AQ16821 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PPP1R3AQ16821 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PPP1R3AQ16821 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PPP1R3AQ16821 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PPP1R3AQ16821 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PPP1R3AQ16821 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PPP1R3AQ16821 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PPP1R3AQ16821 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PPP1R3AQ16821 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PPP1R3AQ16821 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PPP1R3AQ16821 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PPP1R3AQ16821 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PPP1R3AQ16821 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PPP1R3AQ16821 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PPP1R3AQ16821 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PPP1R3AQ16821 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PPP1R3AQ16821 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PPP1R3AQ16821 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PPP1R3AQ16821 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PPP1R3AQ16821 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PPP1R3AQ16821 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PPP1R3AQ16821 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PPP1R3AQ16821 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PPP1R3AQ16821 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PPP1R3AQ16821 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PPP1R3AQ16821 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PPP1R3AQ16821 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PPP1R3AQ16821 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PPP1R3AQ16821 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PPP1R3AQ16821 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PPP1R3AQ16821 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PPP1R3AQ16821 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PPP1R3AQ16821 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PPP1R3AQ16821 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PPP1R3AQ16821 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms