Protein–RNA interactions for Protein: Q16695

HIST3H3, Histone H3.1t, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST3H3Q16695 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HIST3H3Q16695 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HIST3H3Q16695 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HIST3H3Q16695 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HIST3H3Q16695 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HIST3H3Q16695 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HIST3H3Q16695 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HIST3H3Q16695 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HIST3H3Q16695 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HIST3H3Q16695 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HIST3H3Q16695 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HIST3H3Q16695 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HIST3H3Q16695 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HIST3H3Q16695 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HIST3H3Q16695 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HIST3H3Q16695 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HIST3H3Q16695 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HIST3H3Q16695 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HIST3H3Q16695 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
HIST3H3Q16695 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
HIST3H3Q16695 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
HIST3H3Q16695 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
HIST3H3Q16695 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
HIST3H3Q16695 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HIST3H3Q16695 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HIST3H3Q16695 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HIST3H3Q16695 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HIST3H3Q16695 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HIST3H3Q16695 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HIST3H3Q16695 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HIST3H3Q16695 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HIST3H3Q16695 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HIST3H3Q16695 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HIST3H3Q16695 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HIST3H3Q16695 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HIST3H3Q16695 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HIST3H3Q16695 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HIST3H3Q16695 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HIST3H3Q16695 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HIST3H3Q16695 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HIST3H3Q16695 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HIST3H3Q16695 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HIST3H3Q16695 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HIST3H3Q16695 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HIST3H3Q16695 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HIST3H3Q16695 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HIST3H3Q16695 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HIST3H3Q16695 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HIST3H3Q16695 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HIST3H3Q16695 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HIST3H3Q16695 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HIST3H3Q16695 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HIST3H3Q16695 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HIST3H3Q16695 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HIST3H3Q16695 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HIST3H3Q16695 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HIST3H3Q16695 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HIST3H3Q16695 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HIST3H3Q16695 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HIST3H3Q16695 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
HIST3H3Q16695 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HIST3H3Q16695 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HIST3H3Q16695 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HIST3H3Q16695 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HIST3H3Q16695 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HIST3H3Q16695 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HIST3H3Q16695 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HIST3H3Q16695 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HIST3H3Q16695 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HIST3H3Q16695 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HIST3H3Q16695 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HIST3H3Q16695 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HIST3H3Q16695 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HIST3H3Q16695 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HIST3H3Q16695 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HIST3H3Q16695 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HIST3H3Q16695 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
HIST3H3Q16695 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HIST3H3Q16695 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HIST3H3Q16695 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HIST3H3Q16695 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HIST3H3Q16695 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HIST3H3Q16695 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HIST3H3Q16695 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HIST3H3Q16695 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HIST3H3Q16695 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HIST3H3Q16695 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HIST3H3Q16695 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HIST3H3Q16695 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HIST3H3Q16695 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HIST3H3Q16695 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HIST3H3Q16695 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HIST3H3Q16695 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
HIST3H3Q16695 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HIST3H3Q16695 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HIST3H3Q16695 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HIST3H3Q16695 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HIST3H3Q16695 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HIST3H3Q16695 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HIST3H3Q16695 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms