Protein–RNA interactions for Protein: Q16623

STX1A, Syntaxin-1A, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX1AQ16623 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
STX1AQ16623 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
STX1AQ16623 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
STX1AQ16623 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
STX1AQ16623 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
STX1AQ16623 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
STX1AQ16623 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
STX1AQ16623 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
STX1AQ16623 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.72
STX1AQ16623 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
STX1AQ16623 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
STX1AQ16623 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
STX1AQ16623 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
STX1AQ16623 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
STX1AQ16623 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
STX1AQ16623 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
STX1AQ16623 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
STX1AQ16623 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
STX1AQ16623 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
STX1AQ16623 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
STX1AQ16623 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
STX1AQ16623 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
STX1AQ16623 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
STX1AQ16623 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
STX1AQ16623 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
STX1AQ16623 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
STX1AQ16623 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
STX1AQ16623 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
STX1AQ16623 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
STX1AQ16623 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
STX1AQ16623 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
STX1AQ16623 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
STX1AQ16623 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
STX1AQ16623 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
STX1AQ16623 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
STX1AQ16623 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
STX1AQ16623 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
STX1AQ16623 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
STX1AQ16623 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
STX1AQ16623 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
STX1AQ16623 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
STX1AQ16623 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
STX1AQ16623 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
STX1AQ16623 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
STX1AQ16623 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
STX1AQ16623 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
STX1AQ16623 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
STX1AQ16623 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
STX1AQ16623 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
STX1AQ16623 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
STX1AQ16623 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
STX1AQ16623 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
STX1AQ16623 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
STX1AQ16623 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
STX1AQ16623 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
STX1AQ16623 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
STX1AQ16623 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
STX1AQ16623 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
STX1AQ16623 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
STX1AQ16623 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
STX1AQ16623 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
STX1AQ16623 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
STX1AQ16623 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
STX1AQ16623 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
STX1AQ16623 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
STX1AQ16623 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
STX1AQ16623 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
STX1AQ16623 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
STX1AQ16623 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
STX1AQ16623 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
STX1AQ16623 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
STX1AQ16623 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
STX1AQ16623 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
STX1AQ16623 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
STX1AQ16623 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
STX1AQ16623 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
STX1AQ16623 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
STX1AQ16623 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
STX1AQ16623 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
STX1AQ16623 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
STX1AQ16623 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
STX1AQ16623 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
STX1AQ16623 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
STX1AQ16623 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
STX1AQ16623 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
STX1AQ16623 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
STX1AQ16623 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
STX1AQ16623 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
STX1AQ16623 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
STX1AQ16623 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
STX1AQ16623 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
STX1AQ16623 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
STX1AQ16623 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
STX1AQ16623 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
STX1AQ16623 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
STX1AQ16623 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
STX1AQ16623 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
STX1AQ16623 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
STX1AQ16623 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
STX1AQ16623 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
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