Protein–RNA interactions for Protein: Q16549

PCSK7, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 7, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK7Q16549 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCSK7Q16549 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCSK7Q16549 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCSK7Q16549 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCSK7Q16549 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCSK7Q16549 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCSK7Q16549 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCSK7Q16549 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCSK7Q16549 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCSK7Q16549 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCSK7Q16549 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PCSK7Q16549 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCSK7Q16549 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PCSK7Q16549 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCSK7Q16549 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCSK7Q16549 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCSK7Q16549 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCSK7Q16549 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCSK7Q16549 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCSK7Q16549 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCSK7Q16549 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCSK7Q16549 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCSK7Q16549 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCSK7Q16549 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCSK7Q16549 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCSK7Q16549 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCSK7Q16549 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCSK7Q16549 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCSK7Q16549 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCSK7Q16549 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCSK7Q16549 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCSK7Q16549 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCSK7Q16549 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCSK7Q16549 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCSK7Q16549 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCSK7Q16549 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCSK7Q16549 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCSK7Q16549 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCSK7Q16549 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCSK7Q16549 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCSK7Q16549 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCSK7Q16549 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCSK7Q16549 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PCSK7Q16549 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCSK7Q16549 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCSK7Q16549 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCSK7Q16549 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCSK7Q16549 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
PCSK7Q16549 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PCSK7Q16549 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PCSK7Q16549 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PCSK7Q16549 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCSK7Q16549 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCSK7Q16549 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCSK7Q16549 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCSK7Q16549 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCSK7Q16549 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCSK7Q16549 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCSK7Q16549 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCSK7Q16549 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PCSK7Q16549 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCSK7Q16549 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCSK7Q16549 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCSK7Q16549 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCSK7Q16549 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCSK7Q16549 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCSK7Q16549 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCSK7Q16549 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCSK7Q16549 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCSK7Q16549 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCSK7Q16549 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCSK7Q16549 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCSK7Q16549 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCSK7Q16549 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCSK7Q16549 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCSK7Q16549 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCSK7Q16549 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCSK7Q16549 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCSK7Q16549 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PCSK7Q16549 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PCSK7Q16549 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCSK7Q16549 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCSK7Q16549 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCSK7Q16549 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCSK7Q16549 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCSK7Q16549 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCSK7Q16549 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCSK7Q16549 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCSK7Q16549 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCSK7Q16549 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCSK7Q16549 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCSK7Q16549 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCSK7Q16549 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCSK7Q16549 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCSK7Q16549 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PCSK7Q16549 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PCSK7Q16549 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PCSK7Q16549 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PCSK7Q16549 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PCSK7Q16549 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms