Protein–RNA interactions for Protein: Q16540

MRPL23, 39S ribosomal protein L23, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 153 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL23Q16540 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MRPL23Q16540 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MRPL23Q16540 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MRPL23Q16540 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
MRPL23Q16540 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MRPL23Q16540 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MRPL23Q16540 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MRPL23Q16540 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MRPL23Q16540 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MRPL23Q16540 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MRPL23Q16540 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MRPL23Q16540 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MRPL23Q16540 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MRPL23Q16540 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
MRPL23Q16540 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MRPL23Q16540 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MRPL23Q16540 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MRPL23Q16540 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MRPL23Q16540 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MRPL23Q16540 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MRPL23Q16540 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MRPL23Q16540 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MRPL23Q16540 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MRPL23Q16540 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MRPL23Q16540 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MRPL23Q16540 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MRPL23Q16540 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MRPL23Q16540 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MRPL23Q16540 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MRPL23Q16540 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MRPL23Q16540 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MRPL23Q16540 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
MRPL23Q16540 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MRPL23Q16540 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MRPL23Q16540 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MRPL23Q16540 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MRPL23Q16540 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MRPL23Q16540 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MRPL23Q16540 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MRPL23Q16540 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MRPL23Q16540 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MRPL23Q16540 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MRPL23Q16540 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
MRPL23Q16540 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MRPL23Q16540 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MRPL23Q16540 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MRPL23Q16540 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MRPL23Q16540 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MRPL23Q16540 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MRPL23Q16540 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MRPL23Q16540 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MRPL23Q16540 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MRPL23Q16540 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MRPL23Q16540 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MRPL23Q16540 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MRPL23Q16540 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MRPL23Q16540 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MRPL23Q16540 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MRPL23Q16540 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MRPL23Q16540 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MRPL23Q16540 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MRPL23Q16540 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MRPL23Q16540 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MRPL23Q16540 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
MRPL23Q16540 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MRPL23Q16540 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MRPL23Q16540 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MRPL23Q16540 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MRPL23Q16540 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MRPL23Q16540 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MRPL23Q16540 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MRPL23Q16540 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MRPL23Q16540 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MRPL23Q16540 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MRPL23Q16540 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MRPL23Q16540 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
MRPL23Q16540 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MRPL23Q16540 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MRPL23Q16540 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MRPL23Q16540 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MRPL23Q16540 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MRPL23Q16540 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MRPL23Q16540 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MRPL23Q16540 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MRPL23Q16540 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MRPL23Q16540 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MRPL23Q16540 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MRPL23Q16540 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MRPL23Q16540 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
MRPL23Q16540 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MRPL23Q16540 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MRPL23Q16540 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MRPL23Q16540 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MRPL23Q16540 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MRPL23Q16540 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MRPL23Q16540 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MRPL23Q16540 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MRPL23Q16540 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MRPL23Q16540 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MRPL23Q16540 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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