Protein–RNA interactions for Protein: Q16473

TNXA, Putative tenascin-XA, humanhuman

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Length 311 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNXAQ16473 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNXAQ16473 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNXAQ16473 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNXAQ16473 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNXAQ16473 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TNXAQ16473 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TNXAQ16473 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNXAQ16473 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNXAQ16473 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNXAQ16473 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNXAQ16473 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNXAQ16473 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNXAQ16473 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNXAQ16473 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNXAQ16473 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNXAQ16473 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNXAQ16473 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNXAQ16473 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TNXAQ16473 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNXAQ16473 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNXAQ16473 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNXAQ16473 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNXAQ16473 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNXAQ16473 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNXAQ16473 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNXAQ16473 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNXAQ16473 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNXAQ16473 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNXAQ16473 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNXAQ16473 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNXAQ16473 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNXAQ16473 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TNXAQ16473 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TNXAQ16473 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TNXAQ16473 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNXAQ16473 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNXAQ16473 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNXAQ16473 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNXAQ16473 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNXAQ16473 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNXAQ16473 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNXAQ16473 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNXAQ16473 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNXAQ16473 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNXAQ16473 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNXAQ16473 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNXAQ16473 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNXAQ16473 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNXAQ16473 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNXAQ16473 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNXAQ16473 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNXAQ16473 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNXAQ16473 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TNXAQ16473 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TNXAQ16473 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TNXAQ16473 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TNXAQ16473 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TNXAQ16473 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TNXAQ16473 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TNXAQ16473 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TNXAQ16473 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TNXAQ16473 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TNXAQ16473 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TNXAQ16473 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TNXAQ16473 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
TNXAQ16473 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.54
TNXAQ16473 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TNXAQ16473 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TNXAQ16473 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TNXAQ16473 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TNXAQ16473 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TNXAQ16473 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TNXAQ16473 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TNXAQ16473 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TNXAQ16473 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TNXAQ16473 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TNXAQ16473 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TNXAQ16473 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TNXAQ16473 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TNXAQ16473 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TNXAQ16473 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TNXAQ16473 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TNXAQ16473 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TNXAQ16473 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TNXAQ16473 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TNXAQ16473 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TNXAQ16473 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TNXAQ16473 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TNXAQ16473 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TNXAQ16473 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TNXAQ16473 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TNXAQ16473 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TNXAQ16473 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TNXAQ16473 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TNXAQ16473 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TNXAQ16473 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TNXAQ16473 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TNXAQ16473 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TNXAQ16473 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TNXAQ16473 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
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