Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CNGA3Q16281 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CNGA3Q16281 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CNGA3Q16281 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CNGA3Q16281 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CNGA3Q16281 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CNGA3Q16281 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CNGA3Q16281 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CNGA3Q16281 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CNGA3Q16281 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CNGA3Q16281 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CNGA3Q16281 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CNGA3Q16281 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CNGA3Q16281 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CNGA3Q16281 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNGA3Q16281 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNGA3Q16281 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNGA3Q16281 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNGA3Q16281 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNGA3Q16281 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNGA3Q16281 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CNGA3Q16281 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNGA3Q16281 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNGA3Q16281 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNGA3Q16281 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNGA3Q16281 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNGA3Q16281 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNGA3Q16281 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CNGA3Q16281 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNGA3Q16281 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CNGA3Q16281 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CNGA3Q16281 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CNGA3Q16281 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNGA3Q16281 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNGA3Q16281 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNGA3Q16281 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNGA3Q16281 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNGA3Q16281 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNGA3Q16281 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNGA3Q16281 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNGA3Q16281 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNGA3Q16281 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNGA3Q16281 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNGA3Q16281 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNGA3Q16281 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNGA3Q16281 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNGA3Q16281 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNGA3Q16281 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNGA3Q16281 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNGA3Q16281 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNGA3Q16281 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNGA3Q16281 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNGA3Q16281 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNGA3Q16281 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNGA3Q16281 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNGA3Q16281 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNGA3Q16281 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNGA3Q16281 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNGA3Q16281 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNGA3Q16281 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNGA3Q16281 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNGA3Q16281 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNGA3Q16281 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CNGA3Q16281 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNGA3Q16281 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CNGA3Q16281 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNGA3Q16281 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNGA3Q16281 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CNGA3Q16281 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CNGA3Q16281 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNGA3Q16281 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNGA3Q16281 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNGA3Q16281 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNGA3Q16281 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CNGA3Q16281 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CNGA3Q16281 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNGA3Q16281 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNGA3Q16281 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNGA3Q16281 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CNGA3Q16281 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNGA3Q16281 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNGA3Q16281 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNGA3Q16281 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNGA3Q16281 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNGA3Q16281 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNGA3Q16281 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNGA3Q16281 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNGA3Q16281 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNGA3Q16281 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNGA3Q16281 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNGA3Q16281 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNGA3Q16281 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNGA3Q16281 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNGA3Q16281 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNGA3Q16281 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNGA3Q16281 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNGA3Q16281 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNGA3Q16281 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNGA3Q16281 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNGA3Q16281 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
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