Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC6Q16204 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC6Q16204 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC6Q16204 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC6Q16204 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC6Q16204 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC6Q16204 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC6Q16204 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC6Q16204 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC6Q16204 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC6Q16204 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC6Q16204 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC6Q16204 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC6Q16204 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC6Q16204 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CCDC6Q16204 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CCDC6Q16204 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CCDC6Q16204 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CCDC6Q16204 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC6Q16204 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC6Q16204 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC6Q16204 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC6Q16204 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC6Q16204 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC6Q16204 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC6Q16204 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC6Q16204 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC6Q16204 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC6Q16204 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC6Q16204 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC6Q16204 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC6Q16204 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC6Q16204 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC6Q16204 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC6Q16204 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC6Q16204 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC6Q16204 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC6Q16204 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC6Q16204 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC6Q16204 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC6Q16204 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC6Q16204 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC6Q16204 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC6Q16204 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC6Q16204 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC6Q16204 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC6Q16204 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC6Q16204 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC6Q16204 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC6Q16204 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC6Q16204 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC6Q16204 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC6Q16204 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC6Q16204 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC6Q16204 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC6Q16204 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC6Q16204 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC6Q16204 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC6Q16204 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC6Q16204 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC6Q16204 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC6Q16204 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC6Q16204 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC6Q16204 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC6Q16204 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC6Q16204 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC6Q16204 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC6Q16204 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC6Q16204 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC6Q16204 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC6Q16204 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC6Q16204 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC6Q16204 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC6Q16204 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC6Q16204 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC6Q16204 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC6Q16204 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC6Q16204 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC6Q16204 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC6Q16204 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC6Q16204 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC6Q16204 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC6Q16204 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC6Q16204 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC6Q16204 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC6Q16204 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC6Q16204 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC6Q16204 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC6Q16204 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC6Q16204 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC6Q16204 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC6Q16204 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC6Q16204 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC6Q16204 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC6Q16204 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC6Q16204 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC6Q16204 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC6Q16204 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC6Q16204 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC6Q16204 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
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