Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ZFHX3Q15911 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ZFHX3Q15911 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ZFHX3Q15911 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ZFHX3Q15911 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
ZFHX3Q15911 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ZFHX3Q15911 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ZFHX3Q15911 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ZFHX3Q15911 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ZFHX3Q15911 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ZFHX3Q15911 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ZFHX3Q15911 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ZFHX3Q15911 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ZFHX3Q15911 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
ZFHX3Q15911 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ZFHX3Q15911 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ZFHX3Q15911 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ZFHX3Q15911 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ZFHX3Q15911 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ZFHX3Q15911 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ZFHX3Q15911 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ZFHX3Q15911 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ZFHX3Q15911 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ZFHX3Q15911 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ZFHX3Q15911 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ZFHX3Q15911 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ZFHX3Q15911 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ZFHX3Q15911 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
ZFHX3Q15911 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ZFHX3Q15911 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ZFHX3Q15911 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ZFHX3Q15911 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ZFHX3Q15911 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ZFHX3Q15911 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ZFHX3Q15911 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ZFHX3Q15911 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ZFHX3Q15911 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ZFHX3Q15911 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ZFHX3Q15911 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZFHX3Q15911 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZFHX3Q15911 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZFHX3Q15911 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZFHX3Q15911 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZFHX3Q15911 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZFHX3Q15911 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZFHX3Q15911 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZFHX3Q15911 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZFHX3Q15911 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZFHX3Q15911 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZFHX3Q15911 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZFHX3Q15911 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZFHX3Q15911 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZFHX3Q15911 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZFHX3Q15911 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZFHX3Q15911 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZFHX3Q15911 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZFHX3Q15911 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZFHX3Q15911 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
ZFHX3Q15911 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZFHX3Q15911 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZFHX3Q15911 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
ZFHX3Q15911 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZFHX3Q15911 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZFHX3Q15911 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZFHX3Q15911 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
ZFHX3Q15911 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZFHX3Q15911 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZFHX3Q15911 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZFHX3Q15911 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZFHX3Q15911 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZFHX3Q15911 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZFHX3Q15911 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZFHX3Q15911 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZFHX3Q15911 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZFHX3Q15911 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZFHX3Q15911 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZFHX3Q15911 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZFHX3Q15911 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZFHX3Q15911 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZFHX3Q15911 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZFHX3Q15911 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZFHX3Q15911 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZFHX3Q15911 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZFHX3Q15911 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZFHX3Q15911 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZFHX3Q15911 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZFHX3Q15911 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZFHX3Q15911 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZFHX3Q15911 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
ZFHX3Q15911 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZFHX3Q15911 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZFHX3Q15911 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZFHX3Q15911 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZFHX3Q15911 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZFHX3Q15911 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZFHX3Q15911 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZFHX3Q15911 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZFHX3Q15911 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZFHX3Q15911 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZFHX3Q15911 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
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