Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TAF1AQ15573 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TAF1AQ15573 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TAF1AQ15573 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TAF1AQ15573 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TAF1AQ15573 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.27
TAF1AQ15573 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TAF1AQ15573 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TAF1AQ15573 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TAF1AQ15573 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TAF1AQ15573 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TAF1AQ15573 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TAF1AQ15573 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TAF1AQ15573 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TAF1AQ15573 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TAF1AQ15573 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TAF1AQ15573 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TAF1AQ15573 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TAF1AQ15573 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TAF1AQ15573 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TAF1AQ15573 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
TAF1AQ15573 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TAF1AQ15573 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TAF1AQ15573 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TAF1AQ15573 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TAF1AQ15573 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TAF1AQ15573 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TAF1AQ15573 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TAF1AQ15573 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TAF1AQ15573 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TAF1AQ15573 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TAF1AQ15573 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TAF1AQ15573 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TAF1AQ15573 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TAF1AQ15573 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TAF1AQ15573 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TAF1AQ15573 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TAF1AQ15573 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TAF1AQ15573 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TAF1AQ15573 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TAF1AQ15573 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TAF1AQ15573 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TAF1AQ15573 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TAF1AQ15573 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TAF1AQ15573 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TAF1AQ15573 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TAF1AQ15573 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TAF1AQ15573 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TAF1AQ15573 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TAF1AQ15573 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TAF1AQ15573 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TAF1AQ15573 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TAF1AQ15573 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TAF1AQ15573 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TAF1AQ15573 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TAF1AQ15573 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TAF1AQ15573 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TAF1AQ15573 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TAF1AQ15573 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TAF1AQ15573 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TAF1AQ15573 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TAF1AQ15573 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TAF1AQ15573 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TAF1AQ15573 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TAF1AQ15573 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TAF1AQ15573 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TAF1AQ15573 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TAF1AQ15573 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TAF1AQ15573 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TAF1AQ15573 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TAF1AQ15573 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TAF1AQ15573 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TAF1AQ15573 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TAF1AQ15573 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TAF1AQ15573 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TAF1AQ15573 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TAF1AQ15573 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TAF1AQ15573 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TAF1AQ15573 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TAF1AQ15573 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TAF1AQ15573 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TAF1AQ15573 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TAF1AQ15573 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TAF1AQ15573 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TAF1AQ15573 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TAF1AQ15573 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TAF1AQ15573 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TAF1AQ15573 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TAF1AQ15573 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TAF1AQ15573 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TAF1AQ15573 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TAF1AQ15573 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TAF1AQ15573 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TAF1AQ15573 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TAF1AQ15573 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TAF1AQ15573 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TAF1AQ15573 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TAF1AQ15573 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TAF1AQ15573 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TAF1AQ15573 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms