Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
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SEC23BQ15437 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SEC23BQ15437 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SEC23BQ15437 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SEC23BQ15437 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SEC23BQ15437 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SEC23BQ15437 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
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SEC23BQ15437 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SEC23BQ15437 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SEC23BQ15437 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SEC23BQ15437 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SEC23BQ15437 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
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SEC23BQ15437 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
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SEC23BQ15437 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
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SEC23BQ15437 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SEC23BQ15437 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SEC23BQ15437 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
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SEC23BQ15437 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SEC23BQ15437 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SEC23BQ15437 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
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SEC23BQ15437 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
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SEC23BQ15437 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
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SEC23BQ15437 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
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SEC23BQ15437 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SEC23BQ15437 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
SEC23BQ15437 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SEC23BQ15437 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SEC23BQ15437 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SEC23BQ15437 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SEC23BQ15437 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SEC23BQ15437 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
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