Protein–RNA interactions for Protein: Q15406

NR6A1, Nuclear receptor subfamily 6 group A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR6A1Q15406 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NR6A1Q15406 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NR6A1Q15406 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NR6A1Q15406 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NR6A1Q15406 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NR6A1Q15406 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NR6A1Q15406 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NR6A1Q15406 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NR6A1Q15406 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NR6A1Q15406 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NR6A1Q15406 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NR6A1Q15406 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NR6A1Q15406 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NR6A1Q15406 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NR6A1Q15406 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NR6A1Q15406 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NR6A1Q15406 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NR6A1Q15406 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NR6A1Q15406 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NR6A1Q15406 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NR6A1Q15406 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NR6A1Q15406 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NR6A1Q15406 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NR6A1Q15406 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NR6A1Q15406 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NR6A1Q15406 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NR6A1Q15406 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NR6A1Q15406 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NR6A1Q15406 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NR6A1Q15406 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NR6A1Q15406 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NR6A1Q15406 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NR6A1Q15406 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NR6A1Q15406 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NR6A1Q15406 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NR6A1Q15406 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NR6A1Q15406 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NR6A1Q15406 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NR6A1Q15406 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NR6A1Q15406 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NR6A1Q15406 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NR6A1Q15406 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NR6A1Q15406 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NR6A1Q15406 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NR6A1Q15406 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NR6A1Q15406 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NR6A1Q15406 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NR6A1Q15406 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NR6A1Q15406 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NR6A1Q15406 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NR6A1Q15406 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NR6A1Q15406 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NR6A1Q15406 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NR6A1Q15406 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NR6A1Q15406 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NR6A1Q15406 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NR6A1Q15406 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NR6A1Q15406 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NR6A1Q15406 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NR6A1Q15406 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NR6A1Q15406 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NR6A1Q15406 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NR6A1Q15406 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NR6A1Q15406 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NR6A1Q15406 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NR6A1Q15406 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NR6A1Q15406 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NR6A1Q15406 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NR6A1Q15406 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NR6A1Q15406 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NR6A1Q15406 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NR6A1Q15406 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NR6A1Q15406 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NR6A1Q15406 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NR6A1Q15406 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NR6A1Q15406 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NR6A1Q15406 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NR6A1Q15406 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NR6A1Q15406 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NR6A1Q15406 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NR6A1Q15406 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NR6A1Q15406 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NR6A1Q15406 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NR6A1Q15406 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NR6A1Q15406 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NR6A1Q15406 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
NR6A1Q15406 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NR6A1Q15406 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NR6A1Q15406 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NR6A1Q15406 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NR6A1Q15406 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
NR6A1Q15406 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.27■■□□□ 1.15
NR6A1Q15406 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NR6A1Q15406 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NR6A1Q15406 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NR6A1Q15406 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
NR6A1Q15406 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NR6A1Q15406 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NR6A1Q15406 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
NR6A1Q15406 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
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