Protein–RNA interactions for Protein: Q15306

IRF4, Interferon regulatory factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF4Q15306 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IRF4Q15306 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IRF4Q15306 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IRF4Q15306 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IRF4Q15306 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IRF4Q15306 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
IRF4Q15306 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
IRF4Q15306 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
IRF4Q15306 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
IRF4Q15306 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
IRF4Q15306 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
IRF4Q15306 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
IRF4Q15306 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IRF4Q15306 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IRF4Q15306 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IRF4Q15306 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IRF4Q15306 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IRF4Q15306 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IRF4Q15306 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IRF4Q15306 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IRF4Q15306 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IRF4Q15306 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IRF4Q15306 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IRF4Q15306 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IRF4Q15306 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
IRF4Q15306 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IRF4Q15306 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IRF4Q15306 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IRF4Q15306 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IRF4Q15306 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IRF4Q15306 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IRF4Q15306 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IRF4Q15306 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IRF4Q15306 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IRF4Q15306 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IRF4Q15306 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
IRF4Q15306 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
IRF4Q15306 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IRF4Q15306 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IRF4Q15306 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IRF4Q15306 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IRF4Q15306 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
IRF4Q15306 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IRF4Q15306 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IRF4Q15306 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IRF4Q15306 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IRF4Q15306 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IRF4Q15306 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IRF4Q15306 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IRF4Q15306 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IRF4Q15306 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IRF4Q15306 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IRF4Q15306 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IRF4Q15306 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IRF4Q15306 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IRF4Q15306 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IRF4Q15306 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IRF4Q15306 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IRF4Q15306 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IRF4Q15306 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IRF4Q15306 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IRF4Q15306 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IRF4Q15306 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IRF4Q15306 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IRF4Q15306 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IRF4Q15306 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IRF4Q15306 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
IRF4Q15306 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IRF4Q15306 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
IRF4Q15306 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
IRF4Q15306 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IRF4Q15306 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IRF4Q15306 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IRF4Q15306 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IRF4Q15306 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IRF4Q15306 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IRF4Q15306 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IRF4Q15306 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IRF4Q15306 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IRF4Q15306 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IRF4Q15306 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IRF4Q15306 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
IRF4Q15306 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
IRF4Q15306 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IRF4Q15306 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IRF4Q15306 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IRF4Q15306 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IRF4Q15306 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IRF4Q15306 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IRF4Q15306 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IRF4Q15306 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IRF4Q15306 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
IRF4Q15306 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IRF4Q15306 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IRF4Q15306 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IRF4Q15306 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IRF4Q15306 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IRF4Q15306 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IRF4Q15306 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IRF4Q15306 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
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