Protein–RNA interactions for Protein: Q14990

ODF1, Outer dense fiber protein 1, humanhuman

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF1Q14990 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ODF1Q14990 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ODF1Q14990 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ODF1Q14990 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ODF1Q14990 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ODF1Q14990 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ODF1Q14990 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ODF1Q14990 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ODF1Q14990 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ODF1Q14990 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ODF1Q14990 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ODF1Q14990 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ODF1Q14990 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ODF1Q14990 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ODF1Q14990 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ODF1Q14990 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ODF1Q14990 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ODF1Q14990 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ODF1Q14990 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ODF1Q14990 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ODF1Q14990 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ODF1Q14990 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ODF1Q14990 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ODF1Q14990 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ODF1Q14990 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ODF1Q14990 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ODF1Q14990 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ODF1Q14990 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ODF1Q14990 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ODF1Q14990 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ODF1Q14990 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ODF1Q14990 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ODF1Q14990 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ODF1Q14990 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ODF1Q14990 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ODF1Q14990 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ODF1Q14990 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ODF1Q14990 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ODF1Q14990 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ODF1Q14990 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ODF1Q14990 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ODF1Q14990 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ODF1Q14990 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ODF1Q14990 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ODF1Q14990 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ODF1Q14990 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ODF1Q14990 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ODF1Q14990 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ODF1Q14990 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ODF1Q14990 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ODF1Q14990 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ODF1Q14990 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ODF1Q14990 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ODF1Q14990 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ODF1Q14990 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ODF1Q14990 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ODF1Q14990 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ODF1Q14990 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ODF1Q14990 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ODF1Q14990 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ODF1Q14990 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ODF1Q14990 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ODF1Q14990 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ODF1Q14990 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ODF1Q14990 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ODF1Q14990 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ODF1Q14990 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ODF1Q14990 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ODF1Q14990 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ODF1Q14990 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ODF1Q14990 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ODF1Q14990 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ODF1Q14990 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ODF1Q14990 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ODF1Q14990 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ODF1Q14990 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ODF1Q14990 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ODF1Q14990 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ODF1Q14990 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ODF1Q14990 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ODF1Q14990 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ODF1Q14990 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ODF1Q14990 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ODF1Q14990 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ODF1Q14990 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ODF1Q14990 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ODF1Q14990 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ODF1Q14990 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ODF1Q14990 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ODF1Q14990 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ODF1Q14990 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ODF1Q14990 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ODF1Q14990 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ODF1Q14990 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ODF1Q14990 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ODF1Q14990 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ODF1Q14990 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ODF1Q14990 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ODF1Q14990 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ODF1Q14990 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
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