Protein–RNA interactions for Protein: Q13956

PDE6H, Retinal cone rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

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Length 83 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6HQ13956 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PDE6HQ13956 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PDE6HQ13956 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PDE6HQ13956 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PDE6HQ13956 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PDE6HQ13956 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PDE6HQ13956 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PDE6HQ13956 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PDE6HQ13956 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PDE6HQ13956 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PDE6HQ13956 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PDE6HQ13956 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PDE6HQ13956 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PDE6HQ13956 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PDE6HQ13956 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PDE6HQ13956 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PDE6HQ13956 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PDE6HQ13956 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PDE6HQ13956 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PDE6HQ13956 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PDE6HQ13956 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PDE6HQ13956 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PDE6HQ13956 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PDE6HQ13956 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PDE6HQ13956 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PDE6HQ13956 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PDE6HQ13956 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PDE6HQ13956 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PDE6HQ13956 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PDE6HQ13956 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PDE6HQ13956 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PDE6HQ13956 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PDE6HQ13956 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PDE6HQ13956 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PDE6HQ13956 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PDE6HQ13956 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PDE6HQ13956 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PDE6HQ13956 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PDE6HQ13956 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PDE6HQ13956 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PDE6HQ13956 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PDE6HQ13956 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PDE6HQ13956 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PDE6HQ13956 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PDE6HQ13956 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PDE6HQ13956 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PDE6HQ13956 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PDE6HQ13956 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PDE6HQ13956 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PDE6HQ13956 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PDE6HQ13956 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PDE6HQ13956 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PDE6HQ13956 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PDE6HQ13956 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PDE6HQ13956 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PDE6HQ13956 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PDE6HQ13956 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PDE6HQ13956 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PDE6HQ13956 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PDE6HQ13956 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PDE6HQ13956 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PDE6HQ13956 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PDE6HQ13956 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PDE6HQ13956 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PDE6HQ13956 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PDE6HQ13956 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PDE6HQ13956 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PDE6HQ13956 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PDE6HQ13956 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PDE6HQ13956 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PDE6HQ13956 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PDE6HQ13956 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PDE6HQ13956 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PDE6HQ13956 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PDE6HQ13956 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PDE6HQ13956 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PDE6HQ13956 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PDE6HQ13956 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PDE6HQ13956 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PDE6HQ13956 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PDE6HQ13956 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PDE6HQ13956 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PDE6HQ13956 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PDE6HQ13956 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PDE6HQ13956 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PDE6HQ13956 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PDE6HQ13956 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PDE6HQ13956 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PDE6HQ13956 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PDE6HQ13956 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PDE6HQ13956 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PDE6HQ13956 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PDE6HQ13956 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PDE6HQ13956 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PDE6HQ13956 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PDE6HQ13956 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PDE6HQ13956 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PDE6HQ13956 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PDE6HQ13956 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PDE6HQ13956 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
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