Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DDX39BQ13838 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DDX39BQ13838 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DDX39BQ13838 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DDX39BQ13838 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DDX39BQ13838 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DDX39BQ13838 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DDX39BQ13838 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DDX39BQ13838 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DDX39BQ13838 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DDX39BQ13838 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DDX39BQ13838 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DDX39BQ13838 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DDX39BQ13838 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DDX39BQ13838 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DDX39BQ13838 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DDX39BQ13838 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DDX39BQ13838 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DDX39BQ13838 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DDX39BQ13838 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DDX39BQ13838 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DDX39BQ13838 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DDX39BQ13838 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DDX39BQ13838 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DDX39BQ13838 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DDX39BQ13838 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DDX39BQ13838 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DDX39BQ13838 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DDX39BQ13838 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DDX39BQ13838 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DDX39BQ13838 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
DDX39BQ13838 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
DDX39BQ13838 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DDX39BQ13838 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DDX39BQ13838 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DDX39BQ13838 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DDX39BQ13838 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DDX39BQ13838 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DDX39BQ13838 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DDX39BQ13838 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DDX39BQ13838 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DDX39BQ13838 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DDX39BQ13838 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DDX39BQ13838 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DDX39BQ13838 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DDX39BQ13838 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DDX39BQ13838 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DDX39BQ13838 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DDX39BQ13838 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DDX39BQ13838 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DDX39BQ13838 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DDX39BQ13838 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DDX39BQ13838 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
DDX39BQ13838 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
DDX39BQ13838 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
DDX39BQ13838 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DDX39BQ13838 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DDX39BQ13838 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DDX39BQ13838 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DDX39BQ13838 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DDX39BQ13838 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DDX39BQ13838 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
DDX39BQ13838 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DDX39BQ13838 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
DDX39BQ13838 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DDX39BQ13838 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DDX39BQ13838 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DDX39BQ13838 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DDX39BQ13838 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DDX39BQ13838 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DDX39BQ13838 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DDX39BQ13838 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DDX39BQ13838 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DDX39BQ13838 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DDX39BQ13838 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DDX39BQ13838 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DDX39BQ13838 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DDX39BQ13838 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DDX39BQ13838 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DDX39BQ13838 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DDX39BQ13838 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DDX39BQ13838 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DDX39BQ13838 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
DDX39BQ13838 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DDX39BQ13838 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DDX39BQ13838 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DDX39BQ13838 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DDX39BQ13838 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DDX39BQ13838 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DDX39BQ13838 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DDX39BQ13838 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DDX39BQ13838 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DDX39BQ13838 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DDX39BQ13838 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DDX39BQ13838 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DDX39BQ13838 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DDX39BQ13838 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DDX39BQ13838 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DDX39BQ13838 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
DDX39BQ13838 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
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