Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NR1H3Q13133 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NR1H3Q13133 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NR1H3Q13133 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NR1H3Q13133 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NR1H3Q13133 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NR1H3Q13133 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NR1H3Q13133 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NR1H3Q13133 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NR1H3Q13133 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NR1H3Q13133 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NR1H3Q13133 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NR1H3Q13133 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
NR1H3Q13133 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NR1H3Q13133 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NR1H3Q13133 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
NR1H3Q13133 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NR1H3Q13133 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
NR1H3Q13133 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NR1H3Q13133 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NR1H3Q13133 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NR1H3Q13133 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NR1H3Q13133 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NR1H3Q13133 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NR1H3Q13133 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NR1H3Q13133 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NR1H3Q13133 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NR1H3Q13133 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NR1H3Q13133 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NR1H3Q13133 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NR1H3Q13133 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NR1H3Q13133 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NR1H3Q13133 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NR1H3Q13133 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NR1H3Q13133 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NR1H3Q13133 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NR1H3Q13133 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NR1H3Q13133 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NR1H3Q13133 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NR1H3Q13133 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NR1H3Q13133 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NR1H3Q13133 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NR1H3Q13133 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NR1H3Q13133 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NR1H3Q13133 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NR1H3Q13133 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
NR1H3Q13133 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NR1H3Q13133 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NR1H3Q13133 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NR1H3Q13133 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NR1H3Q13133 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NR1H3Q13133 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NR1H3Q13133 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
NR1H3Q13133 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NR1H3Q13133 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NR1H3Q13133 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NR1H3Q13133 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NR1H3Q13133 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NR1H3Q13133 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NR1H3Q13133 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NR1H3Q13133 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NR1H3Q13133 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NR1H3Q13133 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NR1H3Q13133 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NR1H3Q13133 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NR1H3Q13133 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NR1H3Q13133 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NR1H3Q13133 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NR1H3Q13133 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NR1H3Q13133 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NR1H3Q13133 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NR1H3Q13133 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NR1H3Q13133 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NR1H3Q13133 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
NR1H3Q13133 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NR1H3Q13133 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NR1H3Q13133 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
NR1H3Q13133 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NR1H3Q13133 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
NR1H3Q13133 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NR1H3Q13133 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NR1H3Q13133 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NR1H3Q13133 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NR1H3Q13133 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NR1H3Q13133 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NR1H3Q13133 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
NR1H3Q13133 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NR1H3Q13133 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NR1H3Q13133 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
NR1H3Q13133 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NR1H3Q13133 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NR1H3Q13133 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
NR1H3Q13133 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NR1H3Q13133 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
NR1H3Q13133 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NR1H3Q13133 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NR1H3Q13133 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
NR1H3Q13133 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NR1H3Q13133 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NR1H3Q13133 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
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