Protein–RNA interactions for Protein: Q13114

TRAF3, TNF receptor-associated factor 3, humanhuman

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Length 568 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3Q13114 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAF3Q13114 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAF3Q13114 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAF3Q13114 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAF3Q13114 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAF3Q13114 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAF3Q13114 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAF3Q13114 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAF3Q13114 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAF3Q13114 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAF3Q13114 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAF3Q13114 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAF3Q13114 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAF3Q13114 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRAF3Q13114 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRAF3Q13114 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRAF3Q13114 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRAF3Q13114 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRAF3Q13114 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRAF3Q13114 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRAF3Q13114 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRAF3Q13114 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TRAF3Q13114 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRAF3Q13114 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRAF3Q13114 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRAF3Q13114 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRAF3Q13114 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAF3Q13114 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAF3Q13114 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAF3Q13114 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAF3Q13114 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAF3Q13114 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAF3Q13114 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAF3Q13114 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAF3Q13114 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAF3Q13114 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAF3Q13114 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAF3Q13114 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAF3Q13114 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAF3Q13114 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAF3Q13114 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAF3Q13114 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAF3Q13114 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAF3Q13114 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAF3Q13114 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAF3Q13114 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAF3Q13114 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAF3Q13114 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAF3Q13114 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAF3Q13114 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAF3Q13114 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAF3Q13114 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAF3Q13114 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAF3Q13114 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAF3Q13114 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAF3Q13114 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAF3Q13114 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAF3Q13114 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAF3Q13114 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAF3Q13114 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAF3Q13114 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAF3Q13114 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAF3Q13114 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAF3Q13114 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAF3Q13114 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAF3Q13114 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAF3Q13114 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAF3Q13114 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAF3Q13114 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAF3Q13114 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAF3Q13114 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAF3Q13114 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAF3Q13114 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAF3Q13114 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAF3Q13114 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAF3Q13114 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAF3Q13114 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAF3Q13114 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAF3Q13114 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAF3Q13114 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAF3Q13114 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAF3Q13114 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAF3Q13114 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAF3Q13114 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAF3Q13114 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAF3Q13114 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAF3Q13114 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAF3Q13114 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAF3Q13114 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAF3Q13114 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAF3Q13114 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAF3Q13114 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAF3Q13114 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAF3Q13114 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAF3Q13114 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAF3Q13114 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAF3Q13114 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAF3Q13114 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAF3Q13114 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAF3Q13114 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms