Protein–RNA interactions for Protein: Q13084

MRPL28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL28Q13084 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MRPL28Q13084 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MRPL28Q13084 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MRPL28Q13084 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MRPL28Q13084 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MRPL28Q13084 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MRPL28Q13084 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MRPL28Q13084 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MRPL28Q13084 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
MRPL28Q13084 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
MRPL28Q13084 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MRPL28Q13084 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MRPL28Q13084 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MRPL28Q13084 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MRPL28Q13084 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MRPL28Q13084 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MRPL28Q13084 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MRPL28Q13084 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MRPL28Q13084 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MRPL28Q13084 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MRPL28Q13084 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
MRPL28Q13084 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
MRPL28Q13084 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MRPL28Q13084 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MRPL28Q13084 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
MRPL28Q13084 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MRPL28Q13084 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
MRPL28Q13084 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MRPL28Q13084 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
MRPL28Q13084 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MRPL28Q13084 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
MRPL28Q13084 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MRPL28Q13084 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
MRPL28Q13084 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
MRPL28Q13084 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MRPL28Q13084 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MRPL28Q13084 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MRPL28Q13084 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MRPL28Q13084 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MRPL28Q13084 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MRPL28Q13084 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MRPL28Q13084 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MRPL28Q13084 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MRPL28Q13084 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MRPL28Q13084 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MRPL28Q13084 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MRPL28Q13084 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MRPL28Q13084 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MRPL28Q13084 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MRPL28Q13084 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MRPL28Q13084 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
MRPL28Q13084 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MRPL28Q13084 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MRPL28Q13084 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MRPL28Q13084 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MRPL28Q13084 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MRPL28Q13084 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MRPL28Q13084 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MRPL28Q13084 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MRPL28Q13084 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MRPL28Q13084 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MRPL28Q13084 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MRPL28Q13084 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MRPL28Q13084 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MRPL28Q13084 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MRPL28Q13084 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MRPL28Q13084 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MRPL28Q13084 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MRPL28Q13084 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MRPL28Q13084 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MRPL28Q13084 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MRPL28Q13084 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MRPL28Q13084 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MRPL28Q13084 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MRPL28Q13084 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MRPL28Q13084 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MRPL28Q13084 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MRPL28Q13084 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MRPL28Q13084 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MRPL28Q13084 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MRPL28Q13084 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MRPL28Q13084 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MRPL28Q13084 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MRPL28Q13084 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MRPL28Q13084 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MRPL28Q13084 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
MRPL28Q13084 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MRPL28Q13084 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MRPL28Q13084 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MRPL28Q13084 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MRPL28Q13084 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MRPL28Q13084 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MRPL28Q13084 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MRPL28Q13084 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MRPL28Q13084 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MRPL28Q13084 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MRPL28Q13084 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MRPL28Q13084 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
MRPL28Q13084 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MRPL28Q13084 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
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