Protein–RNA interactions for Protein: Q13011

ECH1, Delta(3,5)-Delta(2,4)-dienoyl-CoA isomerase, mitochondrial, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECH1Q13011 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ECH1Q13011 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ECH1Q13011 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ECH1Q13011 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ECH1Q13011 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ECH1Q13011 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ECH1Q13011 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ECH1Q13011 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ECH1Q13011 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ECH1Q13011 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ECH1Q13011 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ECH1Q13011 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ECH1Q13011 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ECH1Q13011 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ECH1Q13011 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ECH1Q13011 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ECH1Q13011 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ECH1Q13011 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ECH1Q13011 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ECH1Q13011 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ECH1Q13011 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ECH1Q13011 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ECH1Q13011 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ECH1Q13011 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ECH1Q13011 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ECH1Q13011 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ECH1Q13011 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ECH1Q13011 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ECH1Q13011 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ECH1Q13011 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ECH1Q13011 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ECH1Q13011 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ECH1Q13011 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ECH1Q13011 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ECH1Q13011 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ECH1Q13011 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ECH1Q13011 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ECH1Q13011 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ECH1Q13011 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ECH1Q13011 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ECH1Q13011 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ECH1Q13011 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ECH1Q13011 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ECH1Q13011 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ECH1Q13011 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ECH1Q13011 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ECH1Q13011 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ECH1Q13011 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ECH1Q13011 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ECH1Q13011 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ECH1Q13011 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ECH1Q13011 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ECH1Q13011 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ECH1Q13011 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ECH1Q13011 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ECH1Q13011 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ECH1Q13011 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ECH1Q13011 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ECH1Q13011 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ECH1Q13011 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ECH1Q13011 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ECH1Q13011 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ECH1Q13011 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ECH1Q13011 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ECH1Q13011 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ECH1Q13011 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ECH1Q13011 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ECH1Q13011 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ECH1Q13011 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ECH1Q13011 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ECH1Q13011 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ECH1Q13011 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ECH1Q13011 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ECH1Q13011 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ECH1Q13011 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ECH1Q13011 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ECH1Q13011 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ECH1Q13011 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ECH1Q13011 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ECH1Q13011 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ECH1Q13011 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ECH1Q13011 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ECH1Q13011 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ECH1Q13011 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ECH1Q13011 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ECH1Q13011 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ECH1Q13011 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ECH1Q13011 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ECH1Q13011 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ECH1Q13011 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ECH1Q13011 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ECH1Q13011 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ECH1Q13011 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ECH1Q13011 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ECH1Q13011 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ECH1Q13011 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ECH1Q13011 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ECH1Q13011 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ECH1Q13011 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ECH1Q13011 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
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