Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GRIK3Q13003 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GRIK3Q13003 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GRIK3Q13003 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GRIK3Q13003 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GRIK3Q13003 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GRIK3Q13003 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GRIK3Q13003 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GRIK3Q13003 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GRIK3Q13003 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GRIK3Q13003 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GRIK3Q13003 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GRIK3Q13003 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GRIK3Q13003 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GRIK3Q13003 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GRIK3Q13003 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GRIK3Q13003 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
GRIK3Q13003 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GRIK3Q13003 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GRIK3Q13003 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GRIK3Q13003 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GRIK3Q13003 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GRIK3Q13003 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GRIK3Q13003 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GRIK3Q13003 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GRIK3Q13003 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GRIK3Q13003 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GRIK3Q13003 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
GRIK3Q13003 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
GRIK3Q13003 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
GRIK3Q13003 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
GRIK3Q13003 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
GRIK3Q13003 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GRIK3Q13003 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GRIK3Q13003 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GRIK3Q13003 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GRIK3Q13003 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
GRIK3Q13003 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GRIK3Q13003 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
GRIK3Q13003 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GRIK3Q13003 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GRIK3Q13003 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GRIK3Q13003 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GRIK3Q13003 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GRIK3Q13003 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GRIK3Q13003 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
GRIK3Q13003 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GRIK3Q13003 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GRIK3Q13003 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GRIK3Q13003 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GRIK3Q13003 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GRIK3Q13003 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GRIK3Q13003 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GRIK3Q13003 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GRIK3Q13003 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GRIK3Q13003 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GRIK3Q13003 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GRIK3Q13003 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GRIK3Q13003 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
GRIK3Q13003 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GRIK3Q13003 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GRIK3Q13003 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GRIK3Q13003 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GRIK3Q13003 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GRIK3Q13003 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GRIK3Q13003 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GRIK3Q13003 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GRIK3Q13003 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GRIK3Q13003 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GRIK3Q13003 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GRIK3Q13003 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GRIK3Q13003 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GRIK3Q13003 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GRIK3Q13003 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GRIK3Q13003 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
GRIK3Q13003 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GRIK3Q13003 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GRIK3Q13003 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GRIK3Q13003 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GRIK3Q13003 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GRIK3Q13003 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GRIK3Q13003 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GRIK3Q13003 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GRIK3Q13003 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GRIK3Q13003 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GRIK3Q13003 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GRIK3Q13003 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GRIK3Q13003 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GRIK3Q13003 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GRIK3Q13003 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GRIK3Q13003 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GRIK3Q13003 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GRIK3Q13003 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GRIK3Q13003 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GRIK3Q13003 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GRIK3Q13003 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GRIK3Q13003 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GRIK3Q13003 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GRIK3Q13003 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GRIK3Q13003 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
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