Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FOXC1Q12948 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FOXC1Q12948 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FOXC1Q12948 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FOXC1Q12948 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FOXC1Q12948 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FOXC1Q12948 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FOXC1Q12948 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FOXC1Q12948 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
FOXC1Q12948 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FOXC1Q12948 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FOXC1Q12948 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
FOXC1Q12948 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FOXC1Q12948 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FOXC1Q12948 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FOXC1Q12948 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
FOXC1Q12948 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FOXC1Q12948 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FOXC1Q12948 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FOXC1Q12948 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FOXC1Q12948 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FOXC1Q12948 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FOXC1Q12948 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FOXC1Q12948 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FOXC1Q12948 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
FOXC1Q12948 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FOXC1Q12948 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FOXC1Q12948 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FOXC1Q12948 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FOXC1Q12948 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FOXC1Q12948 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FOXC1Q12948 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FOXC1Q12948 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FOXC1Q12948 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
FOXC1Q12948 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FOXC1Q12948 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
FOXC1Q12948 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FOXC1Q12948 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FOXC1Q12948 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FOXC1Q12948 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FOXC1Q12948 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FOXC1Q12948 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FOXC1Q12948 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
FOXC1Q12948 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FOXC1Q12948 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FOXC1Q12948 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FOXC1Q12948 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
FOXC1Q12948 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
FOXC1Q12948 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
FOXC1Q12948 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
FOXC1Q12948 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
FOXC1Q12948 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FOXC1Q12948 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FOXC1Q12948 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FOXC1Q12948 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FOXC1Q12948 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FOXC1Q12948 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FOXC1Q12948 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FOXC1Q12948 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
FOXC1Q12948 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FOXC1Q12948 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FOXC1Q12948 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FOXC1Q12948 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FOXC1Q12948 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FOXC1Q12948 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FOXC1Q12948 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FOXC1Q12948 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
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FOXC1Q12948 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FOXC1Q12948 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FOXC1Q12948 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FOXC1Q12948 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FOXC1Q12948 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FOXC1Q12948 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FOXC1Q12948 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FOXC1Q12948 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FOXC1Q12948 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FOXC1Q12948 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
FOXC1Q12948 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
FOXC1Q12948 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FOXC1Q12948 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FOXC1Q12948 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FOXC1Q12948 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FOXC1Q12948 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FOXC1Q12948 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
FOXC1Q12948 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FOXC1Q12948 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FOXC1Q12948 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FOXC1Q12948 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FOXC1Q12948 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22■■□□□ 1.11
FOXC1Q12948 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FOXC1Q12948 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FOXC1Q12948 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
FOXC1Q12948 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
FOXC1Q12948 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FOXC1Q12948 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FOXC1Q12948 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FOXC1Q12948 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FOXC1Q12948 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FOXC1Q12948 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
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