Protein–RNA interactions for Protein: Q12872

SFSWAP, Splicing factor, suppressor of white-apricot homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 951 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFSWAPQ12872 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SFSWAPQ12872 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SFSWAPQ12872 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SFSWAPQ12872 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SFSWAPQ12872 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SFSWAPQ12872 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SFSWAPQ12872 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SFSWAPQ12872 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SFSWAPQ12872 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SFSWAPQ12872 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SFSWAPQ12872 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SFSWAPQ12872 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SFSWAPQ12872 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SFSWAPQ12872 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SFSWAPQ12872 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SFSWAPQ12872 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SFSWAPQ12872 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SFSWAPQ12872 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SFSWAPQ12872 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SFSWAPQ12872 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SFSWAPQ12872 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SFSWAPQ12872 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SFSWAPQ12872 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SFSWAPQ12872 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SFSWAPQ12872 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SFSWAPQ12872 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SFSWAPQ12872 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SFSWAPQ12872 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SFSWAPQ12872 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SFSWAPQ12872 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SFSWAPQ12872 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SFSWAPQ12872 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SFSWAPQ12872 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SFSWAPQ12872 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SFSWAPQ12872 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SFSWAPQ12872 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SFSWAPQ12872 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SFSWAPQ12872 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SFSWAPQ12872 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SFSWAPQ12872 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SFSWAPQ12872 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SFSWAPQ12872 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SFSWAPQ12872 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SFSWAPQ12872 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SFSWAPQ12872 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SFSWAPQ12872 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SFSWAPQ12872 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SFSWAPQ12872 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SFSWAPQ12872 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SFSWAPQ12872 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SFSWAPQ12872 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SFSWAPQ12872 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SFSWAPQ12872 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SFSWAPQ12872 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SFSWAPQ12872 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SFSWAPQ12872 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SFSWAPQ12872 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SFSWAPQ12872 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SFSWAPQ12872 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SFSWAPQ12872 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SFSWAPQ12872 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SFSWAPQ12872 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SFSWAPQ12872 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SFSWAPQ12872 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SFSWAPQ12872 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SFSWAPQ12872 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SFSWAPQ12872 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SFSWAPQ12872 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SFSWAPQ12872 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SFSWAPQ12872 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SFSWAPQ12872 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SFSWAPQ12872 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SFSWAPQ12872 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SFSWAPQ12872 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SFSWAPQ12872 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SFSWAPQ12872 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SFSWAPQ12872 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SFSWAPQ12872 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SFSWAPQ12872 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SFSWAPQ12872 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SFSWAPQ12872 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SFSWAPQ12872 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SFSWAPQ12872 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SFSWAPQ12872 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SFSWAPQ12872 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SFSWAPQ12872 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SFSWAPQ12872 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SFSWAPQ12872 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SFSWAPQ12872 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SFSWAPQ12872 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SFSWAPQ12872 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SFSWAPQ12872 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SFSWAPQ12872 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SFSWAPQ12872 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SFSWAPQ12872 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SFSWAPQ12872 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SFSWAPQ12872 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SFSWAPQ12872 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SFSWAPQ12872 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SFSWAPQ12872 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
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