Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNTN1Q12860 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNTN1Q12860 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CNTN1Q12860 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CNTN1Q12860 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CNTN1Q12860 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNTN1Q12860 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNTN1Q12860 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNTN1Q12860 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNTN1Q12860 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNTN1Q12860 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNTN1Q12860 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNTN1Q12860 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNTN1Q12860 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNTN1Q12860 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNTN1Q12860 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNTN1Q12860 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNTN1Q12860 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNTN1Q12860 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNTN1Q12860 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNTN1Q12860 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNTN1Q12860 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNTN1Q12860 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNTN1Q12860 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNTN1Q12860 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNTN1Q12860 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNTN1Q12860 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNTN1Q12860 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNTN1Q12860 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNTN1Q12860 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNTN1Q12860 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNTN1Q12860 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNTN1Q12860 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNTN1Q12860 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNTN1Q12860 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNTN1Q12860 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNTN1Q12860 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CNTN1Q12860 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNTN1Q12860 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNTN1Q12860 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNTN1Q12860 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNTN1Q12860 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CNTN1Q12860 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNTN1Q12860 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CNTN1Q12860 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNTN1Q12860 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNTN1Q12860 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNTN1Q12860 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNTN1Q12860 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNTN1Q12860 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNTN1Q12860 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNTN1Q12860 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNTN1Q12860 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNTN1Q12860 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNTN1Q12860 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNTN1Q12860 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNTN1Q12860 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNTN1Q12860 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNTN1Q12860 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNTN1Q12860 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNTN1Q12860 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CNTN1Q12860 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CNTN1Q12860 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CNTN1Q12860 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CNTN1Q12860 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CNTN1Q12860 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CNTN1Q12860 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CNTN1Q12860 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CNTN1Q12860 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CNTN1Q12860 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNTN1Q12860 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNTN1Q12860 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNTN1Q12860 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CNTN1Q12860 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNTN1Q12860 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CNTN1Q12860 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CNTN1Q12860 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNTN1Q12860 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CNTN1Q12860 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNTN1Q12860 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNTN1Q12860 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNTN1Q12860 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CNTN1Q12860 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNTN1Q12860 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNTN1Q12860 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNTN1Q12860 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNTN1Q12860 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNTN1Q12860 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNTN1Q12860 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNTN1Q12860 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNTN1Q12860 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNTN1Q12860 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNTN1Q12860 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNTN1Q12860 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNTN1Q12860 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNTN1Q12860 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNTN1Q12860 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNTN1Q12860 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNTN1Q12860 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNTN1Q12860 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
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