Protein–RNA interactions for Protein: Q12846

STX4, Syntaxin-4, humanhuman

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Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4Q12846 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
STX4Q12846 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
STX4Q12846 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
STX4Q12846 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
STX4Q12846 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
STX4Q12846 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
STX4Q12846 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
STX4Q12846 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
STX4Q12846 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
STX4Q12846 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
STX4Q12846 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
STX4Q12846 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
STX4Q12846 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
STX4Q12846 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
STX4Q12846 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
STX4Q12846 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
STX4Q12846 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
STX4Q12846 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
STX4Q12846 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
STX4Q12846 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
STX4Q12846 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
STX4Q12846 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
STX4Q12846 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
STX4Q12846 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
STX4Q12846 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
STX4Q12846 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
STX4Q12846 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
STX4Q12846 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
STX4Q12846 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
STX4Q12846 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
STX4Q12846 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
STX4Q12846 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
STX4Q12846 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
STX4Q12846 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
STX4Q12846 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
STX4Q12846 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
STX4Q12846 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
STX4Q12846 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
STX4Q12846 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
STX4Q12846 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
STX4Q12846 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
STX4Q12846 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
STX4Q12846 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
STX4Q12846 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
STX4Q12846 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
STX4Q12846 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
STX4Q12846 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
STX4Q12846 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
STX4Q12846 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
STX4Q12846 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
STX4Q12846 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
STX4Q12846 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
STX4Q12846 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
STX4Q12846 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
STX4Q12846 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
STX4Q12846 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
STX4Q12846 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
STX4Q12846 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
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STX4Q12846 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
STX4Q12846 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
STX4Q12846 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
STX4Q12846 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
STX4Q12846 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
STX4Q12846 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
STX4Q12846 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
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STX4Q12846 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
STX4Q12846 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
STX4Q12846 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
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STX4Q12846 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
STX4Q12846 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
STX4Q12846 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
STX4Q12846 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
STX4Q12846 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
STX4Q12846 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
STX4Q12846 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
STX4Q12846 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
STX4Q12846 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
STX4Q12846 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
STX4Q12846 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
STX4Q12846 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
STX4Q12846 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
STX4Q12846 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
STX4Q12846 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
STX4Q12846 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
STX4Q12846 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
STX4Q12846 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
STX4Q12846 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
STX4Q12846 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
STX4Q12846 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
STX4Q12846 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
STX4Q12846 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
STX4Q12846 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
STX4Q12846 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
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