Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
KCNMA1Q12791 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KCNMA1Q12791 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KCNMA1Q12791 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KCNMA1Q12791 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KCNMA1Q12791 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KCNMA1Q12791 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KCNMA1Q12791 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KCNMA1Q12791 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KCNMA1Q12791 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
KCNMA1Q12791 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KCNMA1Q12791 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KCNMA1Q12791 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KCNMA1Q12791 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KCNMA1Q12791 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KCNMA1Q12791 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KCNMA1Q12791 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KCNMA1Q12791 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KCNMA1Q12791 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
KCNMA1Q12791 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KCNMA1Q12791 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KCNMA1Q12791 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KCNMA1Q12791 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KCNMA1Q12791 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KCNMA1Q12791 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KCNMA1Q12791 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KCNMA1Q12791 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KCNMA1Q12791 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KCNMA1Q12791 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KCNMA1Q12791 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KCNMA1Q12791 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KCNMA1Q12791 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KCNMA1Q12791 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KCNMA1Q12791 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
KCNMA1Q12791 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KCNMA1Q12791 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KCNMA1Q12791 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KCNMA1Q12791 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KCNMA1Q12791 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KCNMA1Q12791 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KCNMA1Q12791 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
KCNMA1Q12791 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KCNMA1Q12791 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
KCNMA1Q12791 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
KCNMA1Q12791 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KCNMA1Q12791 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KCNMA1Q12791 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KCNMA1Q12791 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KCNMA1Q12791 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KCNMA1Q12791 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KCNMA1Q12791 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KCNMA1Q12791 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KCNMA1Q12791 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KCNMA1Q12791 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KCNMA1Q12791 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KCNMA1Q12791 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KCNMA1Q12791 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KCNMA1Q12791 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
KCNMA1Q12791 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
KCNMA1Q12791 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
KCNMA1Q12791 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
KCNMA1Q12791 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
KCNMA1Q12791 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
KCNMA1Q12791 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
KCNMA1Q12791 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
KCNMA1Q12791 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
KCNMA1Q12791 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
KCNMA1Q12791 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
KCNMA1Q12791 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KCNMA1Q12791 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KCNMA1Q12791 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KCNMA1Q12791 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KCNMA1Q12791 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KCNMA1Q12791 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KCNMA1Q12791 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KCNMA1Q12791 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KCNMA1Q12791 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
KCNMA1Q12791 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KCNMA1Q12791 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KCNMA1Q12791 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KCNMA1Q12791 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KCNMA1Q12791 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KCNMA1Q12791 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KCNMA1Q12791 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KCNMA1Q12791 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KCNMA1Q12791 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KCNMA1Q12791 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KCNMA1Q12791 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KCNMA1Q12791 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
KCNMA1Q12791 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KCNMA1Q12791 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KCNMA1Q12791 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KCNMA1Q12791 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KCNMA1Q12791 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KCNMA1Q12791 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KCNMA1Q12791 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KCNMA1Q12791 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KCNMA1Q12791 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KCNMA1Q12791 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KCNMA1Q12791 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
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