Protein–RNA interactions for Protein: Q12417

PRP46, Pre-mRNA-splicing factor PRP46, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PRP46Q12417 MNN10YDR245W 1182 nt4.64□□□□□ -1.67
PRP46Q12417 NAG1YGR031C-A 492 nt4.64□□□□□ -1.67
PRP46Q12417 TAF11YML015C 1041 nt4.64□□□□□ -1.67
PRP46Q12417 PRE7YBL041W 726 nt4.64□□□□□ -1.67
PRP46Q12417 VTC2YFL004W 2487 nt4.63□□□□□ -1.67
PRP46Q12417 MAL11YGR289C 1851 nt4.63□□□□□ -1.67
PRP46Q12417 RFA1YAR007C 1866 nt4.63□□□□□ -1.67
PRP46Q12417 YGL185CYGL185C 1140 nt4.63□□□□□ -1.67
PRP46Q12417 BGL2YGR282C 942 nt4.63□□□□□ -1.67
PRP46Q12417 YIL028WYIL028W 399 nt4.63□□□□□ -1.67
PRP46Q12417 tX(XXX)DtX(XXX)D 100 nt4.63□□□□□ -1.67
PRP46Q12417 YJL193WYJL193W 1209 nt4.63□□□□□ -1.67
PRP46Q12417 YKR104WYKR104W 921 nt4.63□□□□□ -1.67
PRP46Q12417 YNL019CYNL019C 855 nt4.63□□□□□ -1.67
PRP46Q12417 YNL033WYNL033W 855 nt4.63□□□□□ -1.67
PRP46Q12417 VHS2YIL135C 1311 nt4.63□□□□□ -1.67
PRP46Q12417 YEL077CYEL077C 3834 nt4.63□□□□□ -1.67
PRP46Q12417 BRF1YGR246C 1791 nt4.63□□□□□ -1.67
PRP46Q12417 HPC2YBR215W 1878 nt4.62□□□□□ -1.67
PRP46Q12417 FOL1YNL256W 2475 nt4.62□□□□□ -1.67
PRP46Q12417 RAM1YDL090C 1296 nt4.62□□□□□ -1.67
PRP46Q12417 VCX1YDL128W 1236 nt4.62□□□□□ -1.67
PRP46Q12417 MSH1YHR120W 2880 nt4.62□□□□□ -1.67
PRP46Q12417 MMR1YLR190W 1476 nt4.62□□□□□ -1.67
PRP46Q12417 SEC39YLR440C 2130 nt4.61□□□□□ -1.67
PRP46Q12417 RRP45YDR280W 918 nt4.61□□□□□ -1.67
PRP46Q12417 RPB4YJL140W 666 nt4.61□□□□□ -1.67
PRP46Q12417 MRPL15YLR312W-A 762 nt4.61□□□□□ -1.67
PRP46Q12417 YNR042WYNR042W 429 nt4.61□□□□□ -1.67
PRP46Q12417 RMI1YPL024W 726 nt4.61□□□□□ -1.67
PRP46Q12417 THP1YOL072W 1368 nt4.61□□□□□ -1.67
PRP46Q12417 ADE4YMR300C 1533 nt4.61□□□□□ -1.67
PRP46Q12417 MNN2YBR015C 1794 nt4.6□□□□□ -1.67
PRP46Q12417 tR(ACG)JtR(ACG)J 73 nt4.6□□□□□ -1.67
PRP46Q12417 PHO86YJL117W 936 nt4.6□□□□□ -1.67
PRP46Q12417 NIT2YJL126W 924 nt4.6□□□□□ -1.67
PRP46Q12417 ATH1YPR026W 3636 nt4.6□□□□□ -1.67
PRP46Q12417 ERD1YDR414C 1089 nt4.59□□□□□ -1.67
PRP46Q12417 ATE1YGL017W 1512 nt4.59□□□□□ -1.67
PRP46Q12417 NQM1YGR043C 1002 nt4.59□□□□□ -1.67
PRP46Q12417 SSZ1YHR064C 1617 nt4.59□□□□□ -1.67
PRP46Q12417 PAU17YLL025W 375 nt4.59□□□□□ -1.67
PRP46Q12417 LAP2YNL045W 2016 nt4.59□□□□□ -1.67
PRP46Q12417 JEM1YJL073W 1938 nt4.58□□□□□ -1.68
PRP46Q12417 HPF1YOL155C 2904 nt4.58□□□□□ -1.68
PRP46Q12417 SCM3YDL139C 672 nt4.58□□□□□ -1.68
PRP46Q12417 ARP10YDR106W 855 nt4.58□□□□□ -1.68
PRP46Q12417 YKR041WYKR041W 753 nt4.58□□□□□ -1.68
PRP46Q12417 PML1YLR016C 615 nt4.58□□□□□ -1.68
PRP46Q12417 CKB2YOR039W 777 nt4.58□□□□□ -1.68
PRP46Q12417 PDR10YOR328W 4695 nt4.58□□□□□ -1.68
PRP46Q12417 IMA1YGR287C 1770 nt4.58□□□□□ -1.68
PRP46Q12417 PXA1YPL147W 2613 nt4.58□□□□□ -1.68
PRP46Q12417 RFT1YBL020W 1725 nt4.58□□□□□ -1.68
PRP46Q12417 PMT2YAL023C 2280 nt4.57□□□□□ -1.68
PRP46Q12417 TUB2YFL037W 1374 nt4.57□□□□□ -1.68
PRP46Q12417 IWR1YDL115C 1062 nt4.57□□□□□ -1.68
PRP46Q12417 YJR085CYJR085C 318 nt4.57□□□□□ -1.68
PRP46Q12417 YMR010WYMR010W 1218 nt4.57□□□□□ -1.68
PRP46Q12417 ROT1YMR200W 771 nt4.57□□□□□ -1.68
PRP46Q12417 YNL296WYNL296W 315 nt4.57□□□□□ -1.68
PRP46Q12417 PSE1YMR308C 3270 nt4.57□□□□□ -1.68
PRP46Q12417 ADE3YGR204W 2841 nt4.56□□□□□ -1.68
PRP46Q12417 VHS1YDR247W 1386 nt4.56□□□□□ -1.68
PRP46Q12417 WTM1YOR230W 1314 nt4.56□□□□□ -1.68
PRP46Q12417 GRX4YER174C 735 nt4.56□□□□□ -1.68
PRP46Q12417 MTW1YAL034W-A 870 nt4.56□□□□□ -1.68
PRP46Q12417 KTI12YKL110C 942 nt4.56□□□□□ -1.68
PRP46Q12417 YKL169CYKL169C 384 nt4.56□□□□□ -1.68
PRP46Q12417 TOM5YPR133W-A 153 nt4.56□□□□□ -1.68
PRP46Q12417 SEC9YGR009C 1956 nt4.56□□□□□ -1.68
PRP46Q12417 PRR1YKL116C 1557 nt4.56□□□□□ -1.68
PRP46Q12417 RPN5YDL147W 1338 nt4.55□□□□□ -1.68
PRP46Q12417 YDR053WYDR053W 396 nt4.55□□□□□ -1.68
PRP46Q12417 YJL107CYJL107C 1164 nt4.55□□□□□ -1.68
PRP46Q12417 RPC19YNL113W 429 nt4.55□□□□□ -1.68
PRP46Q12417 RPL3YOR063W 1164 nt4.55□□□□□ -1.68
PRP46Q12417 FUM1YPL262W 1467 nt4.55□□□□□ -1.68
PRP46Q12417 RGT1YKL038W 3513 nt4.55□□□□□ -1.68
PRP46Q12417 IFM1YOL023W 2031 nt4.55□□□□□ -1.68
PRP46Q12417 FAU1YER183C 636 nt4.54□□□□□ -1.68
PRP46Q12417 JAC1YGL018C 555 nt4.54□□□□□ -1.68
PRP46Q12417 MF(ALPHA)2YGL089C 363 nt4.54□□□□□ -1.68
PRP46Q12417 PUS6YGR169C 1215 nt4.54□□□□□ -1.68
PRP46Q12417 NSG1YHR133C 876 nt4.54□□□□□ -1.68
PRP46Q12417 NTR2YKR022C 969 nt4.54□□□□□ -1.68
PRP46Q12417 DRN1YGR093W 1524 nt4.54□□□□□ -1.68
PRP46Q12417 UBA1YKL210W 3075 nt4.54□□□□□ -1.68
PRP46Q12417 SMP1YBR182C 1359 nt4.53□□□□□ -1.68
PRP46Q12417 ASF2YDL197C 1578 nt4.53□□□□□ -1.68
PRP46Q12417 MCX1YBR227C 1563 nt4.53□□□□□ -1.68
PRP46Q12417 YBR139WYBR139W 1527 nt4.53□□□□□ -1.68
PRP46Q12417 YGR291CYGR291C 222 nt4.53□□□□□ -1.68
PRP46Q12417 MRPL4YLR439W 960 nt4.53□□□□□ -1.68
PRP46Q12417 YMR086C-AYMR086C-A 339 nt4.53□□□□□ -1.68
PRP46Q12417 snR3snR3 194 nt4.53□□□□□ -1.68
PRP46Q12417 YBR298C-AYBR298C-A 222 nt4.53□□□□□ -1.68
PRP46Q12417 RRN3YKL125W 1884 nt4.53□□□□□ -1.68
PRP46Q12417 PMT5YDL093W 2232 nt4.53□□□□□ -1.68
PRP46Q12417 STE20YHL007C 2820 nt4.53□□□□□ -1.68
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