Protein–RNA interactions for Protein: Q12316

TY1B-GR3, Transposon Ty1-GR3 Gag-Pol polyprotein, yeastyeast

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Length 1,755 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1B-GR3Q12316 TBF1YPL128C 1689 nt7.08□□□□□ -1.28
TY1B-GR3Q12316 MAS1YLR163C 1389 nt7.07□□□□□ -1.28
TY1B-GR3Q12316 YMR102CYMR102C 2505 nt7.07□□□□□ -1.28
TY1B-GR3Q12316 RXT3YDL076C 885 nt7.07□□□□□ -1.28
TY1B-GR3Q12316 YOR379CYOR379C 339 nt7.07□□□□□ -1.28
TY1B-GR3Q12316 THS1YIL078W 2205 nt7.05□□□□□ -1.28
TY1B-GR3Q12316 NTE1YML059C 5040 nt7.05□□□□□ -1.28
TY1B-GR3Q12316 DCD1YHR144C 939 nt7.05□□□□□ -1.28
TY1B-GR3Q12316 PTK2YJR059W 2457 nt7.05□□□□□ -1.28
TY1B-GR3Q12316 tS(AGA)D3tS(AGA)D3 83 nt7.04□□□□□ -1.28
TY1B-GR3Q12316 ROT2YBR229C 2865 nt7.04□□□□□ -1.28
TY1B-GR3Q12316 NMD3YHR170W 1557 nt7.04□□□□□ -1.28
TY1B-GR3Q12316 LOS1YKL205W 3303 nt7.03□□□□□ -1.28
TY1B-GR3Q12316 PDX3YBR035C 687 nt7.03□□□□□ -1.28
TY1B-GR3Q12316 MET31YPL038W 534 nt7.03□□□□□ -1.28
TY1B-GR3Q12316 ARC1YGL105W 1131 nt7.03□□□□□ -1.28
TY1B-GR3Q12316 MRS3YJL133W 945 nt7.03□□□□□ -1.28
TY1B-GR3Q12316 HMS2YJR147W 1077 nt7.03□□□□□ -1.28
TY1B-GR3Q12316 RFA1YAR007C 1866 nt7.02□□□□□ -1.29
TY1B-GR3Q12316 PUT1YLR142W 1431 nt7.02□□□□□ -1.29
TY1B-GR3Q12316 IRC22YEL001C 678 nt7.02□□□□□ -1.29
TY1B-GR3Q12316 RSC6YCR052W 1452 nt7.02□□□□□ -1.29
TY1B-GR3Q12316 BRE2YLR015W 1518 nt7.01□□□□□ -1.29
TY1B-GR3Q12316 RET1YOR207C 3450 nt7.01□□□□□ -1.29
TY1B-GR3Q12316 RGD1YBR260C 2001 nt7.01□□□□□ -1.29
TY1B-GR3Q12316 YMD8YML038C 1329 nt7.01□□□□□ -1.29
TY1B-GR3Q12316 ARB1YER036C 1833 nt7□□□□□ -1.29
TY1B-GR3Q12316 RSC4YKR008W 1878 nt6.99□□□□□ -1.29
TY1B-GR3Q12316 AIM21YIR003W 2040 nt6.99□□□□□ -1.29
TY1B-GR3Q12316 RIO1YOR119C 1455 nt6.99□□□□□ -1.29
TY1B-GR3Q12316 KCC4YCL024W 3114 nt6.99□□□□□ -1.29
TY1B-GR3Q12316 TRX2YGR209C 315 nt6.99□□□□□ -1.29
TY1B-GR3Q12316 SNF8YPL002C 702 nt6.99□□□□□ -1.29
TY1B-GR3Q12316 SYG1YIL047C 2709 nt6.99□□□□□ -1.29
TY1B-GR3Q12316 NTA1YJR062C 1374 nt6.99□□□□□ -1.29
TY1B-GR3Q12316 COA3YJL062W-A 258 nt6.98□□□□□ -1.29
TY1B-GR3Q12316 KAR2YJL034W 2049 nt6.98□□□□□ -1.29
TY1B-GR3Q12316 UTP11YKL099C 753 nt6.97□□□□□ -1.29
TY1B-GR3Q12316 ASA1YPR085C 1332 nt6.97□□□□□ -1.29
TY1B-GR3Q12316 KGD1YIL125W 3045 nt6.97□□□□□ -1.29
TY1B-GR3Q12316 MCM2YBL023C 2607 nt6.97□□□□□ -1.29
TY1B-GR3Q12316 RPC53YDL150W 1269 nt6.97□□□□□ -1.29
TY1B-GR3Q12316 RPS4BYHR203C 786 nt6.97□□□□□ -1.29
TY1B-GR3Q12316 RPS4AYJR145C 786 nt6.97□□□□□ -1.29
TY1B-GR3Q12316 TRS33YOR115C 807 nt6.96□□□□□ -1.3
TY1B-GR3Q12316 VMA2YBR127C 1554 nt6.95□□□□□ -1.3
TY1B-GR3Q12316 CMK2YOL016C 1344 nt6.95□□□□□ -1.3
TY1B-GR3Q12316 CPR1YDR155C 489 nt6.95□□□□□ -1.3
TY1B-GR3Q12316 YDR161WYDR161W 1164 nt6.95□□□□□ -1.3
TY1B-GR3Q12316 SUL2YLR092W 2682 nt6.95□□□□□ -1.3
TY1B-GR3Q12316 HPM1YIL110W 1134 nt6.95□□□□□ -1.3
TY1B-GR3Q12316 TFG1YGR186W 2208 nt6.94□□□□□ -1.3
TY1B-GR3Q12316 GTO1YGR154C 1071 nt6.93□□□□□ -1.3
TY1B-GR3Q12316 AST1YBL069W 1290 nt6.93□□□□□ -1.3
TY1B-GR3Q12316 SOL1YNR034W 966 nt6.93□□□□□ -1.3
TY1B-GR3Q12316 YDL228CYDL228C 642 nt6.92□□□□□ -1.3
TY1B-GR3Q12316 SFT2YBL102W 648 nt6.92□□□□□ -1.3
TY1B-GR3Q12316 CPR4YCR069W 957 nt6.92□□□□□ -1.3
TY1B-GR3Q12316 RIM101YHL027W 1878 nt6.92□□□□□ -1.3
TY1B-GR3Q12316 CNN1YFR046C 1086 nt6.91□□□□□ -1.3
TY1B-GR3Q12316 YPL162CYPL162C 822 nt6.91□□□□□ -1.3
TY1B-GR3Q12316 SNU66YOR308C 1764 nt6.9□□□□□ -1.3
TY1B-GR3Q12316 GCV1YDR019C 1203 nt6.9□□□□□ -1.3
TY1B-GR3Q12316 YOR131CYOR131C 657 nt6.9□□□□□ -1.3
TY1B-GR3Q12316 PUS1YPL212C 1635 nt6.9□□□□□ -1.31
TY1B-GR3Q12316 GCN20YFR009W 2259 nt6.9□□□□□ -1.31
TY1B-GR3Q12316 snR10snR10 245 nt6.9□□□□□ -1.31
TY1B-GR3Q12316 SGV1YPR161C 1974 nt6.9□□□□□ -1.31
TY1B-GR3Q12316 CPS1YJL172W 1731 nt6.89□□□□□ -1.31
TY1B-GR3Q12316 YCR061WYCR061W 1896 nt6.89□□□□□ -1.31
TY1B-GR3Q12316 FKH2YNL068C 2589 nt6.88□□□□□ -1.31
TY1B-GR3Q12316 POR1YNL055C 852 nt6.87□□□□□ -1.31
TY1B-GR3Q12316 MET16YPR167C 786 nt6.87□□□□□ -1.31
TY1B-GR3Q12316 TRP3YKL211C 1455 nt6.87□□□□□ -1.31
TY1B-GR3Q12316 TRM11YOL124C 1302 nt6.87□□□□□ -1.31
TY1B-GR3Q12316 CSC1YLR241W 2349 nt6.87□□□□□ -1.31
TY1B-GR3Q12316 COX4YGL187C 468 nt6.87□□□□□ -1.31
TY1B-GR3Q12316 PHO87YCR037C 2772 nt6.86□□□□□ -1.31
TY1B-GR3Q12316 UBX7YBR273C 1311 nt6.86□□□□□ -1.31
TY1B-GR3Q12316 CWH43YCR017C 2862 nt6.86□□□□□ -1.31
TY1B-GR3Q12316 RPL12AYEL054C 498 nt6.85□□□□□ -1.31
TY1B-GR3Q12316 BUD25YER014C-A 462 nt6.85□□□□□ -1.31
TY1B-GR3Q12316 ADY3YDL239C 2373 nt6.85□□□□□ -1.31
TY1B-GR3Q12316 KRE29YER038C 1395 nt6.85□□□□□ -1.31
TY1B-GR3Q12316 YDL032WYDL032W 312 nt6.85□□□□□ -1.31
TY1B-GR3Q12316 YDR282CYDR282C 1245 nt6.85□□□□□ -1.31
TY1B-GR3Q12316 ERG20YJL167W 1059 nt6.85□□□□□ -1.31
TY1B-GR3Q12316 YNR065CYNR065C 3351 nt6.84□□□□□ -1.31
TY1B-GR3Q12316 RMI1YPL024W 726 nt6.84□□□□□ -1.31
TY1B-GR3Q12316 YPR059CYPR059C 387 nt6.84□□□□□ -1.31
TY1B-GR3Q12316 VHS2YIL135C 1311 nt6.84□□□□□ -1.32
TY1B-GR3Q12316 MSC2YDR205W 2175 nt6.83□□□□□ -1.32
TY1B-GR3Q12316 RPS14AYCR031C 414 nt6.83□□□□□ -1.32
TY1B-GR3Q12316 RPB7YDR404C 516 nt6.83□□□□□ -1.32
TY1B-GR3Q12316 SPG4YMR107W 348 nt6.83□□□□□ -1.32
TY1B-GR3Q12316 ALD6YPL061W 1503 nt6.83□□□□□ -1.32
TY1B-GR3Q12316 MRPL3YMR024W 1173 nt6.82□□□□□ -1.32
TY1B-GR3Q12316 PCT1YGR202C 1275 nt6.82□□□□□ -1.32
TY1B-GR3Q12316 YIL165CYIL165C 360 nt6.82□□□□□ -1.32
TY1B-GR3Q12316 EGT2YNL327W 3126 nt6.81□□□□□ -1.32
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