Protein–RNA interactions for Protein: Q12309

CLF1, Pre-mRNA-splicing factor CLF1, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 687 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CLF1Q12309 YIL060WYIL060W 435 nt6.02□□□□□ -1.45
CLF1Q12309 ATP14YLR295C 375 nt6.02□□□□□ -1.45
CLF1Q12309 OAZ1YPL052W 879 nt6.02□□□□□ -1.45
CLF1Q12309 TNA1YGR260W 1605 nt6.02□□□□□ -1.45
CLF1Q12309 CYK3YDL117W 2658 nt6.02□□□□□ -1.45
CLF1Q12309 MCX1YBR227C 1563 nt6.01□□□□□ -1.45
CLF1Q12309 EPS1YIL005W 2106 nt6.01□□□□□ -1.45
CLF1Q12309 YDL241WYDL241W 372 nt6.01□□□□□ -1.45
CLF1Q12309 YHR022CYHR022C 771 nt6.01□□□□□ -1.45
CLF1Q12309 YLR412C-AYLR412C-A 207 nt6.01□□□□□ -1.45
CLF1Q12309 ROX3YBL093C 663 nt6.01□□□□□ -1.45
CLF1Q12309 RRP40YOL142W 723 nt6.01□□□□□ -1.45
CLF1Q12309 RRT2YBR246W 1164 nt6.01□□□□□ -1.45
CLF1Q12309 SLD2YKL108W 1362 nt6.01□□□□□ -1.45
CLF1Q12309 KCH1YJR054W 1494 nt6.01□□□□□ -1.45
CLF1Q12309 ACF2YLR144C 2340 nt6□□□□□ -1.45
CLF1Q12309 HRP1YOL123W 1605 nt6□□□□□ -1.45
CLF1Q12309 PCL9YDL179W 915 nt6□□□□□ -1.45
CLF1Q12309 LSM6YDR378C 261 nt6□□□□□ -1.45
CLF1Q12309 YLR296WYLR296W 327 nt6□□□□□ -1.45
CLF1Q12309 VAM3YOR106W 852 nt6□□□□□ -1.45
CLF1Q12309 NOT3YIL038C 2511 nt6□□□□□ -1.45
CLF1Q12309 TUP1YCR084C 2142 nt5.99□□□□□ -1.45
CLF1Q12309 LCB2YDR062W 1686 nt5.99□□□□□ -1.45
CLF1Q12309 THI21YPL258C 1656 nt5.99□□□□□ -1.45
CLF1Q12309 MST1YKL194C 1389 nt5.99□□□□□ -1.45
CLF1Q12309 YDL157CYDL157C 357 nt5.99□□□□□ -1.45
CLF1Q12309 OSW5YMR148W 447 nt5.99□□□□□ -1.45
CLF1Q12309 PGA2YNL149C 390 nt5.99□□□□□ -1.45
CLF1Q12309 RPS19BYNL302C 435 nt5.99□□□□□ -1.45
CLF1Q12309 ETR1YBR026C 1143 nt5.99□□□□□ -1.45
CLF1Q12309 PEX34YCL056C 435 nt5.99□□□□□ -1.45
CLF1Q12309 HEM3YDL205C 984 nt5.98□□□□□ -1.45
CLF1Q12309 MCM21YDR318W 1107 nt5.98□□□□□ -1.45
CLF1Q12309 YJL068CYJL068C 900 nt5.98□□□□□ -1.45
CLF1Q12309 MHO1YJR008W 1017 nt5.98□□□□□ -1.45
CLF1Q12309 DIA1YMR316W 1011 nt5.98□□□□□ -1.45
CLF1Q12309 NCE103YNL036W 666 nt5.98□□□□□ -1.45
CLF1Q12309 RHO2YNL090W 579 nt5.98□□□□□ -1.45
CLF1Q12309 PRT1YOR361C 2292 nt5.98□□□□□ -1.45
CLF1Q12309 PSE1YMR308C 3270 nt5.98□□□□□ -1.45
CLF1Q12309 IMA1YGR287C 1770 nt5.98□□□□□ -1.45
CLF1Q12309 GSY2YLR258W 2118 nt5.98□□□□□ -1.45
CLF1Q12309 ATH1YPR026W 3636 nt5.98□□□□□ -1.45
CLF1Q12309 CLD1YGR110W 1338 nt5.98□□□□□ -1.45
CLF1Q12309 RPL12AYEL054C 498 nt5.97□□□□□ -1.45
CLF1Q12309 CDC43YGL155W 1131 nt5.97□□□□□ -1.45
CLF1Q12309 GTO1YGR154C 1071 nt5.97□□□□□ -1.45
CLF1Q12309 YMR030W-AYMR030W-A 291 nt5.97□□□□□ -1.45
CLF1Q12309 YOL035CYOL035C 303 nt5.97□□□□□ -1.45
CLF1Q12309 VPS28YPL065W 729 nt5.97□□□□□ -1.45
CLF1Q12309 APE1YKL103C 1545 nt5.97□□□□□ -1.45
CLF1Q12309 HOF1YMR032W 2010 nt5.97□□□□□ -1.45
CLF1Q12309 YAL016C-BYAL016C-B 186 nt5.96□□□□□ -1.46
CLF1Q12309 YKL223WYKL223W 333 nt5.96□□□□□ -1.46
CLF1Q12309 CAM1YPL048W 1248 nt5.96□□□□□ -1.46
CLF1Q12309 RET1YOR207C 3450 nt5.96□□□□□ -1.46
CLF1Q12309 RRN3YKL125W 1884 nt5.96□□□□□ -1.46
CLF1Q12309 YIL067CYIL067C 2037 nt5.96□□□□□ -1.46
CLF1Q12309 ATR1YML116W 1629 nt5.96□□□□□ -1.46
CLF1Q12309 ELP2YGR200C 2367 nt5.95□□□□□ -1.46
CLF1Q12309 SNF3YDL194W 2655 nt5.95□□□□□ -1.46
CLF1Q12309 VTH1YIL173W 4650 nt5.95□□□□□ -1.46
CLF1Q12309 VTH2YJL222W 4650 nt5.95□□□□□ -1.46
CLF1Q12309 YGL185CYGL185C 1140 nt5.95□□□□□ -1.46
CLF1Q12309 MRPL25YGR076C 474 nt5.95□□□□□ -1.46
CLF1Q12309 tR(ACG)JtR(ACG)J 73 nt5.95□□□□□ -1.46
CLF1Q12309 ATP12YJL180C 978 nt5.95□□□□□ -1.46
CLF1Q12309 YLL017WYLL017W 312 nt5.95□□□□□ -1.46
CLF1Q12309 YBL044WYBL044W 369 nt5.95□□□□□ -1.46
CLF1Q12309 HOR7YMR251W-A 180 nt5.95□□□□□ -1.46
CLF1Q12309 YNL019CYNL019C 855 nt5.95□□□□□ -1.46
CLF1Q12309 YNL033WYNL033W 855 nt5.95□□□□□ -1.46
CLF1Q12309 LAP2YNL045W 2016 nt5.95□□□□□ -1.46
CLF1Q12309 YGP1YNL160W 1065 nt5.95□□□□□ -1.46
CLF1Q12309 DSC2YOL073C 969 nt5.95□□□□□ -1.46
CLF1Q12309 RAD17YOR368W 1206 nt5.95□□□□□ -1.46
CLF1Q12309 BBP1YPL255W 1158 nt5.95□□□□□ -1.46
CLF1Q12309 ISA2YPR067W 558 nt5.95□□□□□ -1.46
CLF1Q12309 MRE11YMR224C 2079 nt5.95□□□□□ -1.46
CLF1Q12309 FAA4YMR246W 2085 nt5.95□□□□□ -1.46
CLF1Q12309 ATG32YIL146C 1590 nt5.94□□□□□ -1.46
CLF1Q12309 PMA1YGL008C 2757 nt5.94□□□□□ -1.46
CLF1Q12309 MPP10YJR002W 1782 nt5.94□□□□□ -1.46
CLF1Q12309 ASH1YKL185W 1767 nt5.94□□□□□ -1.46
CLF1Q12309 PRP45YAL032C 1140 nt5.94□□□□□ -1.46
CLF1Q12309 MAC1YMR021C 1254 nt5.94□□□□□ -1.46
CLF1Q12309 PPA2YMR267W 933 nt5.94□□□□□ -1.46
CLF1Q12309 RPC19YNL113W 429 nt5.94□□□□□ -1.46
CLF1Q12309 YPL062WYPL062W 405 nt5.94□□□□□ -1.46
CLF1Q12309 CTF18YMR078C 2226 nt5.94□□□□□ -1.46
CLF1Q12309 ATE1YGL017W 1512 nt5.94□□□□□ -1.46
CLF1Q12309 DBF2YGR092W 1719 nt5.94□□□□□ -1.46
CLF1Q12309 SEC39YLR440C 2130 nt5.93□□□□□ -1.46
CLF1Q12309 COQ6YGR255C 1440 nt5.93□□□□□ -1.46
CLF1Q12309 COX3Q0275 810 nt5.93□□□□□ -1.46
CLF1Q12309 MID2YLR332W 1131 nt5.93□□□□□ -1.46
CLF1Q12309 RUF21RUF21 707 nt5.93□□□□□ -1.46
CLF1Q12309 POR1YNL055C 852 nt5.93□□□□□ -1.46
CLF1Q12309 ATG1YGL180W 2694 nt5.92□□□□□ -1.46
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