Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAK6

LMOD3, Leiomodin-3, humanhuman

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD3Q0VAK6 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
LMOD3Q0VAK6 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
LMOD3Q0VAK6 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
LMOD3Q0VAK6 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
LMOD3Q0VAK6 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
LMOD3Q0VAK6 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
LMOD3Q0VAK6 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
LMOD3Q0VAK6 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
LMOD3Q0VAK6 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
LMOD3Q0VAK6 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
LMOD3Q0VAK6 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
LMOD3Q0VAK6 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
LMOD3Q0VAK6 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
LMOD3Q0VAK6 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
LMOD3Q0VAK6 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
LMOD3Q0VAK6 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
LMOD3Q0VAK6 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
LMOD3Q0VAK6 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
LMOD3Q0VAK6 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
LMOD3Q0VAK6 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
LMOD3Q0VAK6 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
LMOD3Q0VAK6 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
LMOD3Q0VAK6 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
LMOD3Q0VAK6 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
LMOD3Q0VAK6 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
LMOD3Q0VAK6 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
LMOD3Q0VAK6 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
LMOD3Q0VAK6 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
LMOD3Q0VAK6 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
LMOD3Q0VAK6 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
LMOD3Q0VAK6 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC30.08■■■□□ 2.41
LMOD3Q0VAK6 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
LMOD3Q0VAK6 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
LMOD3Q0VAK6 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
LMOD3Q0VAK6 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
LMOD3Q0VAK6 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
LMOD3Q0VAK6 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
LMOD3Q0VAK6 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
LMOD3Q0VAK6 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
LMOD3Q0VAK6 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
LMOD3Q0VAK6 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
LMOD3Q0VAK6 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
LMOD3Q0VAK6 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
LMOD3Q0VAK6 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
LMOD3Q0VAK6 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
LMOD3Q0VAK6 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
LMOD3Q0VAK6 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
LMOD3Q0VAK6 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
LMOD3Q0VAK6 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
LMOD3Q0VAK6 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
LMOD3Q0VAK6 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
LMOD3Q0VAK6 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
LMOD3Q0VAK6 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC30.05■■■□□ 2.4
LMOD3Q0VAK6 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
LMOD3Q0VAK6 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
LMOD3Q0VAK6 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
LMOD3Q0VAK6 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
LMOD3Q0VAK6 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
LMOD3Q0VAK6 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
LMOD3Q0VAK6 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC30.04■■■□□ 2.4
LMOD3Q0VAK6 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
LMOD3Q0VAK6 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
LMOD3Q0VAK6 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
LMOD3Q0VAK6 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
LMOD3Q0VAK6 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
LMOD3Q0VAK6 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
LMOD3Q0VAK6 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
LMOD3Q0VAK6 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
LMOD3Q0VAK6 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
LMOD3Q0VAK6 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
LMOD3Q0VAK6 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
LMOD3Q0VAK6 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
LMOD3Q0VAK6 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
LMOD3Q0VAK6 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
LMOD3Q0VAK6 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
LMOD3Q0VAK6 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
LMOD3Q0VAK6 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
LMOD3Q0VAK6 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
LMOD3Q0VAK6 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
LMOD3Q0VAK6 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
LMOD3Q0VAK6 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
LMOD3Q0VAK6 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
LMOD3Q0VAK6 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
LMOD3Q0VAK6 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
LMOD3Q0VAK6 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
LMOD3Q0VAK6 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC30.01■■■□□ 2.39
LMOD3Q0VAK6 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
LMOD3Q0VAK6 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
LMOD3Q0VAK6 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
LMOD3Q0VAK6 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
LMOD3Q0VAK6 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
LMOD3Q0VAK6 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
LMOD3Q0VAK6 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
LMOD3Q0VAK6 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
LMOD3Q0VAK6 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
LMOD3Q0VAK6 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
LMOD3Q0VAK6 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
LMOD3Q0VAK6 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
LMOD3Q0VAK6 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
LMOD3Q0VAK6 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms