Protein–RNA interactions for Protein: Q08945

SSRP1, FACT complex subunit SSRP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSRP1Q08945 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SSRP1Q08945 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SSRP1Q08945 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
SSRP1Q08945 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SSRP1Q08945 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SSRP1Q08945 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SSRP1Q08945 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SSRP1Q08945 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SSRP1Q08945 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SSRP1Q08945 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SSRP1Q08945 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SSRP1Q08945 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SSRP1Q08945 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SSRP1Q08945 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SSRP1Q08945 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SSRP1Q08945 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SSRP1Q08945 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SSRP1Q08945 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SSRP1Q08945 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SSRP1Q08945 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SSRP1Q08945 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SSRP1Q08945 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SSRP1Q08945 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SSRP1Q08945 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SSRP1Q08945 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SSRP1Q08945 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SSRP1Q08945 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SSRP1Q08945 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SSRP1Q08945 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SSRP1Q08945 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SSRP1Q08945 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SSRP1Q08945 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SSRP1Q08945 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SSRP1Q08945 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SSRP1Q08945 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SSRP1Q08945 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SSRP1Q08945 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SSRP1Q08945 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SSRP1Q08945 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SSRP1Q08945 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SSRP1Q08945 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SSRP1Q08945 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SSRP1Q08945 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SSRP1Q08945 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SSRP1Q08945 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SSRP1Q08945 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SSRP1Q08945 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SSRP1Q08945 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SSRP1Q08945 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SSRP1Q08945 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SSRP1Q08945 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SSRP1Q08945 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SSRP1Q08945 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SSRP1Q08945 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SSRP1Q08945 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SSRP1Q08945 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SSRP1Q08945 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SSRP1Q08945 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SSRP1Q08945 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SSRP1Q08945 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SSRP1Q08945 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SSRP1Q08945 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SSRP1Q08945 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SSRP1Q08945 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SSRP1Q08945 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
SSRP1Q08945 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SSRP1Q08945 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SSRP1Q08945 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SSRP1Q08945 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SSRP1Q08945 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SSRP1Q08945 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SSRP1Q08945 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SSRP1Q08945 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
SSRP1Q08945 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
SSRP1Q08945 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SSRP1Q08945 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SSRP1Q08945 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SSRP1Q08945 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SSRP1Q08945 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SSRP1Q08945 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SSRP1Q08945 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SSRP1Q08945 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SSRP1Q08945 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SSRP1Q08945 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SSRP1Q08945 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SSRP1Q08945 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SSRP1Q08945 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SSRP1Q08945 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SSRP1Q08945 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SSRP1Q08945 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SSRP1Q08945 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SSRP1Q08945 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC26.58■■□□□ 1.84
SSRP1Q08945 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
SSRP1Q08945 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.84
SSRP1Q08945 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SSRP1Q08945 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SSRP1Q08945 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SSRP1Q08945 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SSRP1Q08945 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SSRP1Q08945 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms