Protein–RNA interactions for Protein: Q07002

CDK18, Cyclin-dependent kinase 18, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK18Q07002 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDK18Q07002 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDK18Q07002 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDK18Q07002 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDK18Q07002 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CDK18Q07002 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CDK18Q07002 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDK18Q07002 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDK18Q07002 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDK18Q07002 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDK18Q07002 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDK18Q07002 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDK18Q07002 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDK18Q07002 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDK18Q07002 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDK18Q07002 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDK18Q07002 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDK18Q07002 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDK18Q07002 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDK18Q07002 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDK18Q07002 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDK18Q07002 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDK18Q07002 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDK18Q07002 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDK18Q07002 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDK18Q07002 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDK18Q07002 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDK18Q07002 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDK18Q07002 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDK18Q07002 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDK18Q07002 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDK18Q07002 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDK18Q07002 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDK18Q07002 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDK18Q07002 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDK18Q07002 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDK18Q07002 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDK18Q07002 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDK18Q07002 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDK18Q07002 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDK18Q07002 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDK18Q07002 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDK18Q07002 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDK18Q07002 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDK18Q07002 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDK18Q07002 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CDK18Q07002 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDK18Q07002 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDK18Q07002 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDK18Q07002 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDK18Q07002 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDK18Q07002 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDK18Q07002 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDK18Q07002 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDK18Q07002 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDK18Q07002 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDK18Q07002 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDK18Q07002 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDK18Q07002 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CDK18Q07002 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CDK18Q07002 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDK18Q07002 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDK18Q07002 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CDK18Q07002 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDK18Q07002 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDK18Q07002 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDK18Q07002 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDK18Q07002 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDK18Q07002 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDK18Q07002 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDK18Q07002 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDK18Q07002 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDK18Q07002 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDK18Q07002 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDK18Q07002 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDK18Q07002 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDK18Q07002 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDK18Q07002 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDK18Q07002 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDK18Q07002 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDK18Q07002 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDK18Q07002 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDK18Q07002 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDK18Q07002 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDK18Q07002 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDK18Q07002 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDK18Q07002 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDK18Q07002 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CDK18Q07002 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDK18Q07002 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDK18Q07002 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDK18Q07002 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDK18Q07002 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CDK18Q07002 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDK18Q07002 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDK18Q07002 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDK18Q07002 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDK18Q07002 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDK18Q07002 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDK18Q07002 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.1 ms