Protein–RNA interactions for Protein: Q06643

LTB, Lymphotoxin-beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBQ06643 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LTBQ06643 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
LTBQ06643 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
LTBQ06643 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
LTBQ06643 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
LTBQ06643 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LTBQ06643 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
LTBQ06643 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
LTBQ06643 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
LTBQ06643 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
LTBQ06643 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
LTBQ06643 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
LTBQ06643 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
LTBQ06643 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
LTBQ06643 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
LTBQ06643 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
LTBQ06643 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LTBQ06643 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LTBQ06643 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
LTBQ06643 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
LTBQ06643 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LTBQ06643 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LTBQ06643 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
LTBQ06643 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LTBQ06643 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
LTBQ06643 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
LTBQ06643 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
LTBQ06643 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LTBQ06643 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LTBQ06643 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LTBQ06643 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
LTBQ06643 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LTBQ06643 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
LTBQ06643 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LTBQ06643 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
LTBQ06643 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
LTBQ06643 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LTBQ06643 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
LTBQ06643 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
LTBQ06643 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LTBQ06643 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LTBQ06643 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
LTBQ06643 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
LTBQ06643 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
LTBQ06643 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
LTBQ06643 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LTBQ06643 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LTBQ06643 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
LTBQ06643 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
LTBQ06643 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LTBQ06643 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
LTBQ06643 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LTBQ06643 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LTBQ06643 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
LTBQ06643 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
LTBQ06643 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
LTBQ06643 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
LTBQ06643 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
LTBQ06643 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
LTBQ06643 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
LTBQ06643 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
LTBQ06643 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
LTBQ06643 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
LTBQ06643 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
LTBQ06643 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
LTBQ06643 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
LTBQ06643 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
LTBQ06643 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
LTBQ06643 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
LTBQ06643 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
LTBQ06643 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
LTBQ06643 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
LTBQ06643 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
LTBQ06643 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
LTBQ06643 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LTBQ06643 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LTBQ06643 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
LTBQ06643 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LTBQ06643 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
LTBQ06643 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
LTBQ06643 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LTBQ06643 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
LTBQ06643 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
LTBQ06643 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
LTBQ06643 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
LTBQ06643 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LTBQ06643 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LTBQ06643 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LTBQ06643 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
LTBQ06643 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
LTBQ06643 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LTBQ06643 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
LTBQ06643 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LTBQ06643 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LTBQ06643 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
LTBQ06643 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
LTBQ06643 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LTBQ06643 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
LTBQ06643 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
LTBQ06643 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms