Protein–RNA interactions for Protein: Q06432

CACNG1, Voltage-dependent calcium channel gamma-1 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG1Q06432 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CACNG1Q06432 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CACNG1Q06432 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CACNG1Q06432 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CACNG1Q06432 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CACNG1Q06432 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CACNG1Q06432 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CACNG1Q06432 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CACNG1Q06432 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CACNG1Q06432 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CACNG1Q06432 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CACNG1Q06432 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CACNG1Q06432 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CACNG1Q06432 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CACNG1Q06432 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CACNG1Q06432 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CACNG1Q06432 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CACNG1Q06432 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CACNG1Q06432 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CACNG1Q06432 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CACNG1Q06432 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CACNG1Q06432 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CACNG1Q06432 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CACNG1Q06432 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CACNG1Q06432 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CACNG1Q06432 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CACNG1Q06432 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CACNG1Q06432 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CACNG1Q06432 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CACNG1Q06432 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CACNG1Q06432 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CACNG1Q06432 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CACNG1Q06432 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CACNG1Q06432 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CACNG1Q06432 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CACNG1Q06432 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CACNG1Q06432 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CACNG1Q06432 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CACNG1Q06432 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CACNG1Q06432 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CACNG1Q06432 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CACNG1Q06432 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CACNG1Q06432 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CACNG1Q06432 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CACNG1Q06432 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CACNG1Q06432 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CACNG1Q06432 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CACNG1Q06432 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CACNG1Q06432 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CACNG1Q06432 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CACNG1Q06432 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CACNG1Q06432 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CACNG1Q06432 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CACNG1Q06432 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CACNG1Q06432 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CACNG1Q06432 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CACNG1Q06432 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CACNG1Q06432 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CACNG1Q06432 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CACNG1Q06432 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CACNG1Q06432 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CACNG1Q06432 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CACNG1Q06432 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CACNG1Q06432 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CACNG1Q06432 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CACNG1Q06432 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CACNG1Q06432 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CACNG1Q06432 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CACNG1Q06432 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CACNG1Q06432 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CACNG1Q06432 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CACNG1Q06432 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CACNG1Q06432 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CACNG1Q06432 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CACNG1Q06432 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CACNG1Q06432 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CACNG1Q06432 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CACNG1Q06432 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CACNG1Q06432 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CACNG1Q06432 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CACNG1Q06432 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CACNG1Q06432 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CACNG1Q06432 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CACNG1Q06432 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CACNG1Q06432 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CACNG1Q06432 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CACNG1Q06432 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CACNG1Q06432 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CACNG1Q06432 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CACNG1Q06432 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CACNG1Q06432 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CACNG1Q06432 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CACNG1Q06432 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CACNG1Q06432 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CACNG1Q06432 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CACNG1Q06432 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CACNG1Q06432 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CACNG1Q06432 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CACNG1Q06432 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CACNG1Q06432 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms