Protein–RNA interactions for Protein: Q04323

UBXN1, UBX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN1Q04323 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
UBXN1Q04323 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
UBXN1Q04323 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
UBXN1Q04323 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
UBXN1Q04323 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
UBXN1Q04323 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
UBXN1Q04323 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
UBXN1Q04323 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
UBXN1Q04323 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
UBXN1Q04323 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
UBXN1Q04323 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
UBXN1Q04323 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
UBXN1Q04323 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
UBXN1Q04323 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
UBXN1Q04323 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
UBXN1Q04323 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
UBXN1Q04323 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
UBXN1Q04323 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
UBXN1Q04323 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
UBXN1Q04323 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
UBXN1Q04323 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
UBXN1Q04323 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
UBXN1Q04323 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
UBXN1Q04323 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
UBXN1Q04323 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
UBXN1Q04323 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
UBXN1Q04323 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
UBXN1Q04323 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
UBXN1Q04323 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
UBXN1Q04323 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
UBXN1Q04323 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
UBXN1Q04323 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
UBXN1Q04323 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
UBXN1Q04323 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
UBXN1Q04323 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
UBXN1Q04323 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
UBXN1Q04323 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
UBXN1Q04323 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
UBXN1Q04323 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
UBXN1Q04323 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
UBXN1Q04323 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
UBXN1Q04323 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
UBXN1Q04323 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
UBXN1Q04323 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
UBXN1Q04323 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
UBXN1Q04323 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
UBXN1Q04323 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
UBXN1Q04323 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
UBXN1Q04323 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
UBXN1Q04323 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
UBXN1Q04323 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
UBXN1Q04323 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
UBXN1Q04323 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
UBXN1Q04323 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
UBXN1Q04323 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
UBXN1Q04323 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
UBXN1Q04323 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
UBXN1Q04323 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
UBXN1Q04323 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
UBXN1Q04323 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
UBXN1Q04323 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
UBXN1Q04323 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
UBXN1Q04323 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
UBXN1Q04323 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
UBXN1Q04323 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
UBXN1Q04323 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
UBXN1Q04323 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
UBXN1Q04323 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
UBXN1Q04323 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
UBXN1Q04323 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
UBXN1Q04323 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
UBXN1Q04323 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
UBXN1Q04323 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
UBXN1Q04323 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
UBXN1Q04323 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
UBXN1Q04323 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
UBXN1Q04323 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
UBXN1Q04323 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
UBXN1Q04323 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
UBXN1Q04323 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
UBXN1Q04323 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
UBXN1Q04323 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
UBXN1Q04323 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
UBXN1Q04323 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
UBXN1Q04323 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
UBXN1Q04323 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
UBXN1Q04323 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
UBXN1Q04323 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
UBXN1Q04323 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
UBXN1Q04323 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
UBXN1Q04323 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
UBXN1Q04323 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
UBXN1Q04323 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
UBXN1Q04323 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
UBXN1Q04323 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
UBXN1Q04323 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
UBXN1Q04323 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
UBXN1Q04323 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
UBXN1Q04323 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
UBXN1Q04323 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms