Protein–RNA interactions for Protein: Q03518

TAP1, Antigen peptide transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 808 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAP1Q03518 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TAP1Q03518 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TAP1Q03518 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TAP1Q03518 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TAP1Q03518 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
TAP1Q03518 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TAP1Q03518 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TAP1Q03518 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TAP1Q03518 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TAP1Q03518 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
TAP1Q03518 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TAP1Q03518 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TAP1Q03518 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
TAP1Q03518 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TAP1Q03518 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TAP1Q03518 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TAP1Q03518 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TAP1Q03518 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TAP1Q03518 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TAP1Q03518 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TAP1Q03518 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TAP1Q03518 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TAP1Q03518 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TAP1Q03518 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TAP1Q03518 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TAP1Q03518 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TAP1Q03518 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TAP1Q03518 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TAP1Q03518 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TAP1Q03518 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
TAP1Q03518 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TAP1Q03518 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TAP1Q03518 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TAP1Q03518 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TAP1Q03518 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TAP1Q03518 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TAP1Q03518 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TAP1Q03518 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TAP1Q03518 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TAP1Q03518 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TAP1Q03518 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TAP1Q03518 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
TAP1Q03518 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TAP1Q03518 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TAP1Q03518 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TAP1Q03518 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TAP1Q03518 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TAP1Q03518 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TAP1Q03518 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TAP1Q03518 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TAP1Q03518 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TAP1Q03518 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TAP1Q03518 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TAP1Q03518 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TAP1Q03518 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TAP1Q03518 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TAP1Q03518 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
TAP1Q03518 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TAP1Q03518 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TAP1Q03518 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TAP1Q03518 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
TAP1Q03518 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TAP1Q03518 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TAP1Q03518 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TAP1Q03518 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TAP1Q03518 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
TAP1Q03518 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TAP1Q03518 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TAP1Q03518 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TAP1Q03518 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TAP1Q03518 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TAP1Q03518 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TAP1Q03518 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TAP1Q03518 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TAP1Q03518 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TAP1Q03518 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
TAP1Q03518 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TAP1Q03518 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TAP1Q03518 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TAP1Q03518 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TAP1Q03518 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TAP1Q03518 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TAP1Q03518 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TAP1Q03518 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TAP1Q03518 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TAP1Q03518 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TAP1Q03518 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TAP1Q03518 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TAP1Q03518 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TAP1Q03518 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TAP1Q03518 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TAP1Q03518 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TAP1Q03518 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TAP1Q03518 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TAP1Q03518 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TAP1Q03518 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TAP1Q03518 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
TAP1Q03518 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TAP1Q03518 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TAP1Q03518 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms