Protein–RNA interactions for Protein: Q03395

ROM1, Rod outer segment membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROM1Q03395 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ROM1Q03395 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ROM1Q03395 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ROM1Q03395 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ROM1Q03395 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ROM1Q03395 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ROM1Q03395 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ROM1Q03395 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ROM1Q03395 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ROM1Q03395 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ROM1Q03395 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ROM1Q03395 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ROM1Q03395 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ROM1Q03395 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ROM1Q03395 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ROM1Q03395 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ROM1Q03395 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ROM1Q03395 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ROM1Q03395 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ROM1Q03395 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ROM1Q03395 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ROM1Q03395 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ROM1Q03395 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ROM1Q03395 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ROM1Q03395 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ROM1Q03395 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ROM1Q03395 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ROM1Q03395 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ROM1Q03395 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ROM1Q03395 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ROM1Q03395 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ROM1Q03395 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ROM1Q03395 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ROM1Q03395 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ROM1Q03395 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ROM1Q03395 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ROM1Q03395 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ROM1Q03395 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ROM1Q03395 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ROM1Q03395 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ROM1Q03395 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ROM1Q03395 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ROM1Q03395 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ROM1Q03395 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ROM1Q03395 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ROM1Q03395 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ROM1Q03395 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ROM1Q03395 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ROM1Q03395 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ROM1Q03395 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ROM1Q03395 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ROM1Q03395 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ROM1Q03395 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ROM1Q03395 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ROM1Q03395 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ROM1Q03395 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ROM1Q03395 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ROM1Q03395 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ROM1Q03395 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ROM1Q03395 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ROM1Q03395 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ROM1Q03395 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ROM1Q03395 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ROM1Q03395 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ROM1Q03395 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ROM1Q03395 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ROM1Q03395 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ROM1Q03395 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ROM1Q03395 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ROM1Q03395 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ROM1Q03395 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ROM1Q03395 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ROM1Q03395 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ROM1Q03395 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ROM1Q03395 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ROM1Q03395 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ROM1Q03395 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ROM1Q03395 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ROM1Q03395 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ROM1Q03395 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ROM1Q03395 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ROM1Q03395 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ROM1Q03395 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ROM1Q03395 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ROM1Q03395 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ROM1Q03395 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ROM1Q03395 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ROM1Q03395 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ROM1Q03395 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ROM1Q03395 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ROM1Q03395 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ROM1Q03395 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ROM1Q03395 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ROM1Q03395 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ROM1Q03395 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ROM1Q03395 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ROM1Q03395 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ROM1Q03395 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ROM1Q03395 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ROM1Q03395 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms