Protein–RNA interactions for Protein: Q03280

TOM1, E3 ubiquitin-protein ligase TOM1, yeastyeast

Predictions only

Length 3,268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TOM1Q03280 ATF1YOR377W 1578 nt5.07□□□□□ -1.6
TOM1Q03280 API2YDR525W 330 nt5.06□□□□□ -1.6
TOM1Q03280 YOR131CYOR131C 657 nt5.06□□□□□ -1.6
TOM1Q03280 BUD25YER014C-A 462 nt5.06□□□□□ -1.6
TOM1Q03280 FRA2YGL220W 363 nt5.06□□□□□ -1.6
TOM1Q03280 KIP2YPL155C 2121 nt5.06□□□□□ -1.6
TOM1Q03280 MAL11YGR289C 1851 nt5.06□□□□□ -1.6
TOM1Q03280 PHM7YOL084W 2976 nt5.05□□□□□ -1.6
TOM1Q03280 BZZ1YHR114W 1902 nt5.05□□□□□ -1.6
TOM1Q03280 NUP42YDR192C 1293 nt5.05□□□□□ -1.6
TOM1Q03280 YPL041CYPL041C 624 nt5.04□□□□□ -1.6
TOM1Q03280 YML101C-AYML101C-A 318 nt5.04□□□□□ -1.6
TOM1Q03280 STE50YCL032W 1041 nt5.04□□□□□ -1.6
TOM1Q03280 AIP1YMR092C 1848 nt5.04□□□□□ -1.6
TOM1Q03280 UBA1YKL210W 3075 nt5.03□□□□□ -1.6
TOM1Q03280 CLB1YGR108W 1416 nt5.03□□□□□ -1.6
TOM1Q03280 YER187WYER187W 426 nt5.03□□□□□ -1.6
TOM1Q03280 SEC12YNR026C 1416 nt5.03□□□□□ -1.6
TOM1Q03280 YDR514CYDR514C 1452 nt5.03□□□□□ -1.6
TOM1Q03280 HMX1YLR205C 954 nt5.03□□□□□ -1.6
TOM1Q03280 YBL044WYBL044W 369 nt5.03□□□□□ -1.6
TOM1Q03280 HAS1YMR290C 1518 nt5.02□□□□□ -1.61
TOM1Q03280 CHO1YER026C 831 nt5.01□□□□□ -1.61
TOM1Q03280 GTT2YLL060C 702 nt5.01□□□□□ -1.61
TOM1Q03280 IGO2YHR132W-A 396 nt5.01□□□□□ -1.61
TOM1Q03280 ZUO1YGR285C 1302 nt5□□□□□ -1.61
TOM1Q03280 UBX2YML013W 1755 nt5□□□□□ -1.61
TOM1Q03280 HPM1YIL110W 1134 nt5□□□□□ -1.61
TOM1Q03280 TFG1YGR186W 2208 nt4.99□□□□□ -1.61
TOM1Q03280 YER145C-AYER145C-A 438 nt4.99□□□□□ -1.61
TOM1Q03280 PRE4YFR050C 801 nt4.99□□□□□ -1.61
TOM1Q03280 DCD1YHR144C 939 nt4.99□□□□□ -1.61
TOM1Q03280 YDR230WYDR230W 348 nt4.99□□□□□ -1.61
TOM1Q03280 GTT1YIR038C 705 nt4.99□□□□□ -1.61
TOM1Q03280 MAD2YJL030W 591 nt4.99□□□□□ -1.61
TOM1Q03280 DAK1YML070W 1755 nt4.99□□□□□ -1.61
TOM1Q03280 MIC26YGR235C 702 nt4.98□□□□□ -1.61
TOM1Q03280 SSB2YNL209W 1842 nt4.98□□□□□ -1.61
TOM1Q03280 KTR5YNL029C 1569 nt4.98□□□□□ -1.61
TOM1Q03280 ZRT1YGL255W 1131 nt4.98□□□□□ -1.61
TOM1Q03280 YGR017WYGR017W 894 nt4.98□□□□□ -1.61
TOM1Q03280 YHR182WYHR182W 2358 nt4.98□□□□□ -1.61
TOM1Q03280 GLO2YDR272W 825 nt4.98□□□□□ -1.61
TOM1Q03280 RAD14YMR201C 1116 nt4.98□□□□□ -1.61
TOM1Q03280 YBR219CYBR219C 384 nt4.98□□□□□ -1.61
TOM1Q03280 YIL108WYIL108W 2091 nt4.97□□□□□ -1.61
TOM1Q03280 VPS4YPR173C 1314 nt4.97□□□□□ -1.61
TOM1Q03280 MSW1YDR268W 1140 nt4.96□□□□□ -1.61
TOM1Q03280 KEX2YNL238W 2445 nt4.96□□□□□ -1.62
TOM1Q03280 CSC1YLR241W 2349 nt4.96□□□□□ -1.62
TOM1Q03280 SIP2YGL208W 1248 nt4.96□□□□□ -1.62
TOM1Q03280 TLG2YOL018C 1194 nt4.96□□□□□ -1.62
TOM1Q03280 VPS30YPL120W 1674 nt4.96□□□□□ -1.62
TOM1Q03280 DBP8YHR169W 1296 nt4.96□□□□□ -1.62
TOM1Q03280 RPS0AYGR214W 759 nt4.95□□□□□ -1.62
TOM1Q03280 YIL165CYIL165C 360 nt4.95□□□□□ -1.62
TOM1Q03280 AST1YBL069W 1290 nt4.95□□□□□ -1.62
TOM1Q03280 YSF3YNL138W-A 258 nt4.95□□□□□ -1.62
TOM1Q03280 YGR153WYGR153W 654 nt4.95□□□□□ -1.62
TOM1Q03280 RPL22AYLR061W 366 nt4.95□□□□□ -1.62
TOM1Q03280 NHP6BYBR089C-A 300 nt4.95□□□□□ -1.62
TOM1Q03280 MRPL3YMR024W 1173 nt4.94□□□□□ -1.62
TOM1Q03280 FLC1YPL221W 2382 nt4.94□□□□□ -1.62
TOM1Q03280 ADY3YDL239C 2373 nt4.94□□□□□ -1.62
TOM1Q03280 PBS2YJL128C 2007 nt4.94□□□□□ -1.62
TOM1Q03280 UPS3YDR185C 540 nt4.94□□□□□ -1.62
TOM1Q03280 RPA49YNL248C 1248 nt4.94□□□□□ -1.62
TOM1Q03280 MEU1YLR017W 1014 nt4.93□□□□□ -1.62
TOM1Q03280 PCS60YBR222C 1632 nt4.93□□□□□ -1.62
TOM1Q03280 PGM2YMR105C 1710 nt4.93□□□□□ -1.62
TOM1Q03280 ROD1YOR018W 2514 nt4.92□□□□□ -1.62
TOM1Q03280 PFA3YNL326C 1011 nt4.92□□□□□ -1.62
TOM1Q03280 RRT2YBR246W 1164 nt4.92□□□□□ -1.62
TOM1Q03280 MRC1YCL061C 3291 nt4.92□□□□□ -1.62
TOM1Q03280 TRS23YDR246W 660 nt4.92□□□□□ -1.62
TOM1Q03280 RTT109YLL002W 1311 nt4.92□□□□□ -1.62
TOM1Q03280 IMP1YMR150C 573 nt4.91□□□□□ -1.62
TOM1Q03280 MTW1YAL034W-A 870 nt4.91□□□□□ -1.62
TOM1Q03280 VCX1YDL128W 1236 nt4.9□□□□□ -1.62
TOM1Q03280 SDS3YIL084C 984 nt4.9□□□□□ -1.62
TOM1Q03280 IRC9YJL142C 393 nt4.9□□□□□ -1.62
TOM1Q03280 SDA1YGR245C 2304 nt4.9□□□□□ -1.63
TOM1Q03280 RFA2YNL312W 822 nt4.9□□□□□ -1.63
TOM1Q03280 TRM11YOL124C 1302 nt4.9□□□□□ -1.63
TOM1Q03280 FRT1YOR324C 1809 nt4.9□□□□□ -1.63
TOM1Q03280 CCR4YAL021C 2514 nt4.89□□□□□ -1.63
TOM1Q03280 NUP1YOR098C 3231 nt4.89□□□□□ -1.63
TOM1Q03280 BSC1YDL037C 987 nt4.89□□□□□ -1.63
TOM1Q03280 DPH1YIL103W 1278 nt4.89□□□□□ -1.63
TOM1Q03280 YMR245WYMR245W 621 nt4.89□□□□□ -1.63
TOM1Q03280 TFB3YDR460W 966 nt4.89□□□□□ -1.63
TOM1Q03280 YBL006W-AYBL006W-A 150 nt4.89□□□□□ -1.63
TOM1Q03280 FLD1YLR404W 858 nt4.89□□□□□ -1.63
TOM1Q03280 JEN1YKL217W 1851 nt4.88□□□□□ -1.63
TOM1Q03280 RRB1YMR131C 1536 nt4.88□□□□□ -1.63
TOM1Q03280 SNA2YDR525W-A 240 nt4.88□□□□□ -1.63
TOM1Q03280 ECT1YGR007W 972 nt4.88□□□□□ -1.63
TOM1Q03280 PDR10YOR328W 4695 nt4.88□□□□□ -1.63
TOM1Q03280 ATO2YNR002C 849 nt4.88□□□□□ -1.63
TOM1Q03280 GAD1YMR250W 1758 nt4.87□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 12 ms