Protein–RNA interactions for Protein: Q03052

POU3F1, POU domain, class 3, transcription factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU3F1Q03052 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
POU3F1Q03052 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
POU3F1Q03052 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
POU3F1Q03052 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
POU3F1Q03052 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
POU3F1Q03052 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
POU3F1Q03052 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
POU3F1Q03052 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
POU3F1Q03052 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
POU3F1Q03052 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
POU3F1Q03052 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
POU3F1Q03052 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
POU3F1Q03052 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
POU3F1Q03052 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
POU3F1Q03052 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
POU3F1Q03052 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
POU3F1Q03052 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
POU3F1Q03052 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
POU3F1Q03052 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
POU3F1Q03052 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
POU3F1Q03052 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
POU3F1Q03052 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
POU3F1Q03052 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
POU3F1Q03052 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
POU3F1Q03052 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
POU3F1Q03052 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
POU3F1Q03052 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
POU3F1Q03052 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
POU3F1Q03052 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
POU3F1Q03052 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
POU3F1Q03052 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
POU3F1Q03052 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
POU3F1Q03052 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
POU3F1Q03052 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
POU3F1Q03052 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
POU3F1Q03052 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
POU3F1Q03052 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
POU3F1Q03052 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
POU3F1Q03052 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
POU3F1Q03052 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
POU3F1Q03052 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
POU3F1Q03052 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
POU3F1Q03052 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
POU3F1Q03052 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
POU3F1Q03052 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
POU3F1Q03052 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
POU3F1Q03052 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
POU3F1Q03052 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
POU3F1Q03052 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
POU3F1Q03052 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
POU3F1Q03052 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
POU3F1Q03052 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
POU3F1Q03052 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
POU3F1Q03052 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
POU3F1Q03052 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
POU3F1Q03052 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
POU3F1Q03052 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
POU3F1Q03052 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
POU3F1Q03052 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
POU3F1Q03052 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
POU3F1Q03052 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
POU3F1Q03052 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
POU3F1Q03052 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
POU3F1Q03052 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
POU3F1Q03052 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
POU3F1Q03052 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
POU3F1Q03052 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
POU3F1Q03052 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
POU3F1Q03052 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
POU3F1Q03052 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
POU3F1Q03052 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
POU3F1Q03052 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
POU3F1Q03052 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
POU3F1Q03052 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
POU3F1Q03052 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
POU3F1Q03052 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
POU3F1Q03052 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
POU3F1Q03052 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
POU3F1Q03052 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
POU3F1Q03052 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
POU3F1Q03052 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
POU3F1Q03052 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
POU3F1Q03052 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
POU3F1Q03052 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
POU3F1Q03052 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
POU3F1Q03052 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
POU3F1Q03052 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
POU3F1Q03052 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
POU3F1Q03052 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
POU3F1Q03052 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
POU3F1Q03052 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
POU3F1Q03052 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
POU3F1Q03052 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
POU3F1Q03052 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
POU3F1Q03052 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
POU3F1Q03052 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
POU3F1Q03052 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
POU3F1Q03052 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
POU3F1Q03052 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
POU3F1Q03052 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms