Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CACNB1Q02641 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CACNB1Q02641 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CACNB1Q02641 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CACNB1Q02641 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CACNB1Q02641 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CACNB1Q02641 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CACNB1Q02641 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CACNB1Q02641 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CACNB1Q02641 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CACNB1Q02641 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CACNB1Q02641 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CACNB1Q02641 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CACNB1Q02641 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CACNB1Q02641 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CACNB1Q02641 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CACNB1Q02641 EIF2S2P5-201ENST00000457635 968 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CACNB1Q02641 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CACNB1Q02641 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CACNB1Q02641 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CACNB1Q02641 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CACNB1Q02641 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CACNB1Q02641 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CACNB1Q02641 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CACNB1Q02641 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CACNB1Q02641 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CACNB1Q02641 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CACNB1Q02641 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CACNB1Q02641 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CACNB1Q02641 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CACNB1Q02641 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CACNB1Q02641 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CACNB1Q02641 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CACNB1Q02641 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CACNB1Q02641 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CACNB1Q02641 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CACNB1Q02641 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CACNB1Q02641 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
CACNB1Q02641 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CACNB1Q02641 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CACNB1Q02641 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CACNB1Q02641 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CACNB1Q02641 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CACNB1Q02641 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CACNB1Q02641 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CACNB1Q02641 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CACNB1Q02641 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CACNB1Q02641 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CACNB1Q02641 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CACNB1Q02641 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CACNB1Q02641 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CACNB1Q02641 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CACNB1Q02641 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CACNB1Q02641 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CACNB1Q02641 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CACNB1Q02641 IL20-201ENST00000367096 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CACNB1Q02641 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CACNB1Q02641 AC079349.1-201ENST00000509096 589 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CACNB1Q02641 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CACNB1Q02641 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CACNB1Q02641 AC022079.1-201ENST00000621546 602 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
CACNB1Q02641 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CACNB1Q02641 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CACNB1Q02641 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CACNB1Q02641 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CACNB1Q02641 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CACNB1Q02641 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CACNB1Q02641 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CACNB1Q02641 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CACNB1Q02641 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CACNB1Q02641 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CACNB1Q02641 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CACNB1Q02641 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CACNB1Q02641 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CACNB1Q02641 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CACNB1Q02641 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CACNB1Q02641 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CACNB1Q02641 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CACNB1Q02641 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CACNB1Q02641 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CACNB1Q02641 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CACNB1Q02641 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CACNB1Q02641 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CACNB1Q02641 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CACNB1Q02641 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CACNB1Q02641 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CACNB1Q02641 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CACNB1Q02641 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CACNB1Q02641 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CACNB1Q02641 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CACNB1Q02641 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CACNB1Q02641 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CACNB1Q02641 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CACNB1Q02641 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CACNB1Q02641 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CACNB1Q02641 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CACNB1Q02641 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CACNB1Q02641 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CACNB1Q02641 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CACNB1Q02641 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms