Protein–RNA interactions for Protein: Q01954

BNC1, Zinc finger protein basonuclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC1Q01954 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BNC1Q01954 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BNC1Q01954 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BNC1Q01954 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BNC1Q01954 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BNC1Q01954 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BNC1Q01954 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BNC1Q01954 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
BNC1Q01954 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BNC1Q01954 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BNC1Q01954 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BNC1Q01954 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BNC1Q01954 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BNC1Q01954 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BNC1Q01954 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BNC1Q01954 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BNC1Q01954 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
BNC1Q01954 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BNC1Q01954 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BNC1Q01954 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BNC1Q01954 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BNC1Q01954 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BNC1Q01954 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BNC1Q01954 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BNC1Q01954 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BNC1Q01954 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BNC1Q01954 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BNC1Q01954 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BNC1Q01954 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BNC1Q01954 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BNC1Q01954 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BNC1Q01954 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BNC1Q01954 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BNC1Q01954 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
BNC1Q01954 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BNC1Q01954 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BNC1Q01954 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
BNC1Q01954 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BNC1Q01954 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BNC1Q01954 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BNC1Q01954 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
BNC1Q01954 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BNC1Q01954 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BNC1Q01954 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BNC1Q01954 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BNC1Q01954 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BNC1Q01954 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
BNC1Q01954 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
BNC1Q01954 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BNC1Q01954 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BNC1Q01954 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BNC1Q01954 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BNC1Q01954 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BNC1Q01954 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BNC1Q01954 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
BNC1Q01954 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BNC1Q01954 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BNC1Q01954 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BNC1Q01954 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BNC1Q01954 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BNC1Q01954 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BNC1Q01954 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BNC1Q01954 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BNC1Q01954 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BNC1Q01954 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BNC1Q01954 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BNC1Q01954 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BNC1Q01954 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BNC1Q01954 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BNC1Q01954 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BNC1Q01954 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BNC1Q01954 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BNC1Q01954 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BNC1Q01954 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BNC1Q01954 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BNC1Q01954 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BNC1Q01954 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BNC1Q01954 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BNC1Q01954 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BNC1Q01954 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BNC1Q01954 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BNC1Q01954 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BNC1Q01954 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
BNC1Q01954 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
BNC1Q01954 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BNC1Q01954 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BNC1Q01954 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
BNC1Q01954 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BNC1Q01954 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BNC1Q01954 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BNC1Q01954 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BNC1Q01954 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
BNC1Q01954 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BNC1Q01954 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BNC1Q01954 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BNC1Q01954 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BNC1Q01954 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BNC1Q01954 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BNC1Q01954 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BNC1Q01954 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms