Protein–RNA interactions for Protein: Q01892

SPIB, Transcription factor Spi-B, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIBQ01892 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPIBQ01892 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPIBQ01892 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPIBQ01892 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPIBQ01892 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPIBQ01892 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPIBQ01892 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPIBQ01892 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPIBQ01892 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPIBQ01892 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPIBQ01892 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPIBQ01892 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPIBQ01892 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPIBQ01892 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPIBQ01892 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPIBQ01892 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPIBQ01892 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPIBQ01892 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPIBQ01892 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPIBQ01892 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPIBQ01892 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPIBQ01892 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPIBQ01892 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPIBQ01892 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SPIBQ01892 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SPIBQ01892 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SPIBQ01892 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SPIBQ01892 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SPIBQ01892 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SPIBQ01892 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SPIBQ01892 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SPIBQ01892 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SPIBQ01892 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SPIBQ01892 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SPIBQ01892 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SPIBQ01892 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SPIBQ01892 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SPIBQ01892 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SPIBQ01892 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SPIBQ01892 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SPIBQ01892 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SPIBQ01892 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SPIBQ01892 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SPIBQ01892 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SPIBQ01892 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SPIBQ01892 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SPIBQ01892 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SPIBQ01892 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SPIBQ01892 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SPIBQ01892 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SPIBQ01892 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SPIBQ01892 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SPIBQ01892 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SPIBQ01892 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SPIBQ01892 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SPIBQ01892 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SPIBQ01892 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SPIBQ01892 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SPIBQ01892 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SPIBQ01892 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SPIBQ01892 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SPIBQ01892 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SPIBQ01892 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SPIBQ01892 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SPIBQ01892 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SPIBQ01892 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SPIBQ01892 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SPIBQ01892 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SPIBQ01892 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SPIBQ01892 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SPIBQ01892 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SPIBQ01892 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SPIBQ01892 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SPIBQ01892 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SPIBQ01892 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SPIBQ01892 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SPIBQ01892 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SPIBQ01892 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SPIBQ01892 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SPIBQ01892 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SPIBQ01892 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SPIBQ01892 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SPIBQ01892 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SPIBQ01892 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SPIBQ01892 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SPIBQ01892 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SPIBQ01892 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SPIBQ01892 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SPIBQ01892 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SPIBQ01892 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SPIBQ01892 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SPIBQ01892 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SPIBQ01892 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SPIBQ01892 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SPIBQ01892 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SPIBQ01892 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SPIBQ01892 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SPIBQ01892 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SPIBQ01892 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SPIBQ01892 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.1 ms