Protein–RNA interactions for Protein: Q00597

FANCC, Fanconi anemia group C protein, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCCQ00597 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FANCCQ00597 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FANCCQ00597 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FANCCQ00597 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FANCCQ00597 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FANCCQ00597 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FANCCQ00597 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FANCCQ00597 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FANCCQ00597 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FANCCQ00597 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FANCCQ00597 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FANCCQ00597 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FANCCQ00597 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
FANCCQ00597 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FANCCQ00597 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FANCCQ00597 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FANCCQ00597 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FANCCQ00597 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FANCCQ00597 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FANCCQ00597 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FANCCQ00597 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FANCCQ00597 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FANCCQ00597 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FANCCQ00597 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FANCCQ00597 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FANCCQ00597 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FANCCQ00597 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FANCCQ00597 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FANCCQ00597 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FANCCQ00597 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
FANCCQ00597 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FANCCQ00597 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FANCCQ00597 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FANCCQ00597 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FANCCQ00597 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FANCCQ00597 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FANCCQ00597 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FANCCQ00597 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FANCCQ00597 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FANCCQ00597 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FANCCQ00597 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FANCCQ00597 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FANCCQ00597 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FANCCQ00597 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FANCCQ00597 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FANCCQ00597 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FANCCQ00597 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
FANCCQ00597 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FANCCQ00597 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
FANCCQ00597 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
FANCCQ00597 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FANCCQ00597 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FANCCQ00597 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FANCCQ00597 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
FANCCQ00597 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FANCCQ00597 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FANCCQ00597 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FANCCQ00597 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FANCCQ00597 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FANCCQ00597 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FANCCQ00597 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FANCCQ00597 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FANCCQ00597 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FANCCQ00597 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FANCCQ00597 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
FANCCQ00597 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FANCCQ00597 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FANCCQ00597 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FANCCQ00597 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FANCCQ00597 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FANCCQ00597 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FANCCQ00597 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FANCCQ00597 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FANCCQ00597 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FANCCQ00597 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FANCCQ00597 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FANCCQ00597 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FANCCQ00597 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FANCCQ00597 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FANCCQ00597 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FANCCQ00597 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FANCCQ00597 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FANCCQ00597 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FANCCQ00597 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FANCCQ00597 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FANCCQ00597 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
FANCCQ00597 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
FANCCQ00597 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FANCCQ00597 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FANCCQ00597 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FANCCQ00597 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FANCCQ00597 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FANCCQ00597 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FANCCQ00597 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FANCCQ00597 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FANCCQ00597 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FANCCQ00597 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FANCCQ00597 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FANCCQ00597 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FANCCQ00597 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms