Protein–RNA interactions for Protein: P98177

FOXO4, Forkhead box protein O4, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO4P98177 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
FOXO4P98177 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
FOXO4P98177 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
FOXO4P98177 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
FOXO4P98177 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
FOXO4P98177 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
FOXO4P98177 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
FOXO4P98177 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
FOXO4P98177 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
FOXO4P98177 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
FOXO4P98177 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
FOXO4P98177 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
FOXO4P98177 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
FOXO4P98177 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
FOXO4P98177 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
FOXO4P98177 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
FOXO4P98177 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
FOXO4P98177 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
FOXO4P98177 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
FOXO4P98177 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
FOXO4P98177 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
FOXO4P98177 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
FOXO4P98177 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
FOXO4P98177 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
FOXO4P98177 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
FOXO4P98177 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
FOXO4P98177 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
FOXO4P98177 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
FOXO4P98177 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
FOXO4P98177 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
FOXO4P98177 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
FOXO4P98177 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
FOXO4P98177 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
FOXO4P98177 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
FOXO4P98177 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
FOXO4P98177 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
FOXO4P98177 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
FOXO4P98177 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
FOXO4P98177 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
FOXO4P98177 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
FOXO4P98177 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
FOXO4P98177 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
FOXO4P98177 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
FOXO4P98177 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
FOXO4P98177 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
FOXO4P98177 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
FOXO4P98177 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
FOXO4P98177 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
FOXO4P98177 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
FOXO4P98177 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
FOXO4P98177 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
FOXO4P98177 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
FOXO4P98177 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
FOXO4P98177 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
FOXO4P98177 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
FOXO4P98177 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
FOXO4P98177 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
FOXO4P98177 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
FOXO4P98177 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
FOXO4P98177 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
FOXO4P98177 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
FOXO4P98177 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
FOXO4P98177 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
FOXO4P98177 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
FOXO4P98177 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
FOXO4P98177 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
FOXO4P98177 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
FOXO4P98177 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
FOXO4P98177 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
FOXO4P98177 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
FOXO4P98177 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
FOXO4P98177 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
FOXO4P98177 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
FOXO4P98177 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
FOXO4P98177 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
FOXO4P98177 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
FOXO4P98177 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
FOXO4P98177 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
FOXO4P98177 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC28.63■■■□□ 2.17
FOXO4P98177 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
FOXO4P98177 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
FOXO4P98177 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
FOXO4P98177 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
FOXO4P98177 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
FOXO4P98177 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
FOXO4P98177 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
FOXO4P98177 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
FOXO4P98177 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
FOXO4P98177 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
FOXO4P98177 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
FOXO4P98177 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
FOXO4P98177 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
FOXO4P98177 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
FOXO4P98177 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
FOXO4P98177 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
FOXO4P98177 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
FOXO4P98177 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
FOXO4P98177 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
FOXO4P98177 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
FOXO4P98177 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms