Protein–RNA interactions for Protein: P78412

IRX6, Iroquois-class homeodomain protein IRX-6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX6P78412 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
IRX6P78412 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
IRX6P78412 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
IRX6P78412 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
IRX6P78412 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
IRX6P78412 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
IRX6P78412 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
IRX6P78412 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
IRX6P78412 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
IRX6P78412 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
IRX6P78412 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
IRX6P78412 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
IRX6P78412 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
IRX6P78412 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
IRX6P78412 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
IRX6P78412 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
IRX6P78412 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
IRX6P78412 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
IRX6P78412 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
IRX6P78412 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
IRX6P78412 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
IRX6P78412 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
IRX6P78412 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
IRX6P78412 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
IRX6P78412 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
IRX6P78412 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
IRX6P78412 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
IRX6P78412 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
IRX6P78412 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
IRX6P78412 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
IRX6P78412 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
IRX6P78412 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
IRX6P78412 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
IRX6P78412 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
IRX6P78412 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
IRX6P78412 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
IRX6P78412 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
IRX6P78412 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
IRX6P78412 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
IRX6P78412 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
IRX6P78412 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
IRX6P78412 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
IRX6P78412 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
IRX6P78412 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
IRX6P78412 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
IRX6P78412 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
IRX6P78412 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
IRX6P78412 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
IRX6P78412 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
IRX6P78412 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
IRX6P78412 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
IRX6P78412 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
IRX6P78412 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
IRX6P78412 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
IRX6P78412 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
IRX6P78412 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
IRX6P78412 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
IRX6P78412 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
IRX6P78412 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
IRX6P78412 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
IRX6P78412 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
IRX6P78412 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
IRX6P78412 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
IRX6P78412 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
IRX6P78412 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
IRX6P78412 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
IRX6P78412 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
IRX6P78412 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
IRX6P78412 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
IRX6P78412 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.37
IRX6P78412 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
IRX6P78412 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
IRX6P78412 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
IRX6P78412 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
IRX6P78412 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
IRX6P78412 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
IRX6P78412 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
IRX6P78412 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
IRX6P78412 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
IRX6P78412 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
IRX6P78412 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
IRX6P78412 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
IRX6P78412 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
IRX6P78412 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
IRX6P78412 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
IRX6P78412 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
IRX6P78412 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
IRX6P78412 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
IRX6P78412 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
IRX6P78412 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
IRX6P78412 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
IRX6P78412 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
IRX6P78412 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
IRX6P78412 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
IRX6P78412 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
IRX6P78412 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
IRX6P78412 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
IRX6P78412 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
IRX6P78412 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
IRX6P78412 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.7 ms