Protein–RNA interactions for Protein: P78314

SH3BP2, SH3 domain-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2P78314 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SH3BP2P78314 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SH3BP2P78314 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SH3BP2P78314 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SH3BP2P78314 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SH3BP2P78314 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SH3BP2P78314 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SH3BP2P78314 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SH3BP2P78314 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SH3BP2P78314 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SH3BP2P78314 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SH3BP2P78314 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SH3BP2P78314 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SH3BP2P78314 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SH3BP2P78314 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SH3BP2P78314 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SH3BP2P78314 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SH3BP2P78314 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SH3BP2P78314 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SH3BP2P78314 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SH3BP2P78314 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SH3BP2P78314 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SH3BP2P78314 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SH3BP2P78314 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SH3BP2P78314 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SH3BP2P78314 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SH3BP2P78314 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SH3BP2P78314 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SH3BP2P78314 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SH3BP2P78314 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SH3BP2P78314 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SH3BP2P78314 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SH3BP2P78314 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SH3BP2P78314 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SH3BP2P78314 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SH3BP2P78314 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SH3BP2P78314 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SH3BP2P78314 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SH3BP2P78314 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SH3BP2P78314 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SH3BP2P78314 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SH3BP2P78314 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SH3BP2P78314 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SH3BP2P78314 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SH3BP2P78314 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SH3BP2P78314 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SH3BP2P78314 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SH3BP2P78314 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SH3BP2P78314 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SH3BP2P78314 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SH3BP2P78314 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SH3BP2P78314 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SH3BP2P78314 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SH3BP2P78314 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SH3BP2P78314 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SH3BP2P78314 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SH3BP2P78314 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SH3BP2P78314 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SH3BP2P78314 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SH3BP2P78314 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SH3BP2P78314 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SH3BP2P78314 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SH3BP2P78314 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SH3BP2P78314 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SH3BP2P78314 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SH3BP2P78314 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SH3BP2P78314 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SH3BP2P78314 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SH3BP2P78314 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SH3BP2P78314 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SH3BP2P78314 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SH3BP2P78314 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SH3BP2P78314 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SH3BP2P78314 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SH3BP2P78314 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SH3BP2P78314 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SH3BP2P78314 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SH3BP2P78314 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SH3BP2P78314 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SH3BP2P78314 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SH3BP2P78314 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SH3BP2P78314 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SH3BP2P78314 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SH3BP2P78314 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SH3BP2P78314 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SH3BP2P78314 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SH3BP2P78314 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SH3BP2P78314 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SH3BP2P78314 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SH3BP2P78314 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SH3BP2P78314 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SH3BP2P78314 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SH3BP2P78314 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SH3BP2P78314 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SH3BP2P78314 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SH3BP2P78314 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SH3BP2P78314 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SH3BP2P78314 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SH3BP2P78314 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SH3BP2P78314 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms